پیش بینی تعامل دارو و پروتئین هدف بر پایه حداقل رساندن نرم هسته ای وزن دار و گراف شباهت بین داروها و پروتئین های هدف

شناسایی تعامل بین دارو و پروتئین های هدف، نقش بسیار مهمی در فرایند کشف داور دارد. از آنجایی که انجام آزمایشات پیش بینی این فرایند زمانبر، بسیار پرهزینه و خسته کننده می باشد. پیش بینی محاسباتی می تواند یک راهکار مناسبی برای کاهش فضای جستجو برای بررسی تعامل بین دارو و هدف بجای استفاده از آزمایشات پرهزینه باشد. در این مقاله یک راهکار نوین بر اساس، تعامل های شناخته شده در بین دارو- هدف بر پایه گراف شباهت ارائه شده است. در این مقاله نشان داده شده که این کاربرد جز مسائل با مرتبه پایین می باشند که در این راستا از روش حداقل رساندن نرم هسته ای وزنی، برای تشخیص تعامل دارو و هدف استفاده شده است. روش پیشنهادی بر روی چهار مجموعه داده معیار شامل آنزیم ها (Es)، کانال های یونی (IC)، گیرنده های همراه پروتئینی GPCRs)G) و گیرنده های هسته ای (NRs) بر اساس معیارهای AUPR, AUC مورد ارزیابی قرار گرفته است. نتایج بدست آمده نشان دهنده بهبود عملکرد روش پیشنهادی می باشد.

Keywords:

تعاملات دارو- هدف , پیش بینی محاسباتی , حداقل رساندن نرم هسته ای وزنی , گراف شباهت