تجزیه و تحلیل غنیسازی مجموعههای ژنی با استفاده از مطالعات پویش کل ژنومی جهت شناسایی ژنها و مسیرهای مرتبط با تعداد نتاج در نژادهای مختلف گوسفند

هدف از این پژوهش، بررسی صفت تعداد نتاج در هر زایش میش به­عنوان یک صفت تولید­مثلی مهم بود. به این منظور از رکوردهای فنوتیپی هفت نژاد گوسفند وادی، هوی، ایسلندی، فین­شیپ و رومانوف با باروری بالا و نژادهای تکسل و راهمنی با باروری پایین، برای مطالعه پویش ژنومی بر پایه آنالیز غنی­سازی بهمنظور شناسایی مکانیسم­­های زیستی استفاده شد. ارزیابی پویش کل ژنومی در بسته GenABEL برنامه R انجام شد. آنالیز غنی­سازی مجموعه ژنی با بسته نرمافزاری goseq برنامه R با هدف شناسایی طبقات عملکردی و مسیرهای زیستی ژن­های نزدیک در مناطق انتخابی کاندیدا انجام شد. در این پژوهش ژن­های BMP۵، DHCR۲۴، BMPR۱B، ESR۱، ESR۲ و PLCB۱ در نژادهای وادی و رومانوف، ژن­های SMAD۱، SMAD۲، INSR و PTGS۲ در نژادهای فین­شیپ و هوی، ژن­های BMP۷، NCOA۱ و ERBB۴ در گوسفند ایسلند، ژن­های BMP۴، MSRB۳ و SPP۱ در نژاد تکسل، و ژن­های BMP۷، EGFR و KCNMA۱ در نژاد راهمنی با تعداد نتاج متولدشده مرتبط بودند. در تحلیل غنی­سازی مجموعه­های ژنی، تعداد ۳۰ مسیر با صفت تعداد نتاج در هر زایش مرتبط بودند. از بین مسیرهای زیستی شناساییشده، مسیرهای TGF-β signaling pathway،Oxytocin signaling pathway ، Estrogen signaling pathway، Prolactin signaling pathway وInsulin signaling pathway نقش مهمی در نرخ تخمک­ریزی و چند قلوزایی داشتند. با توجه به تایید مناطق قبلی پویش ژنومی و شناسایی مناطق ژنومی جدید، استفاده از یافته­های این پژوهش می­تواند در انتخاب ژنتیکی گوسفند از طریق تعداد نتاج بیشتر در هر زایش مفید باشد.

Keywords:

آنالیز غنیسازی , پویش ژنوم , چند قلوزایی , گوسفند , مسیرهای زیستی