شناسایی گونه های جدیدی از دی ازوتروف های اندوفیت همیار برنج و گندم با استفاده از آنالیز ژن ۱۶S rDNA و FTIR

در این مطالعه شش جدایه اندوفیت، شامل سه جدایه از ریشه سه رقم برنج (جدایه های PxR۱، PxR۲ و StR۱) و سه جدایه از ریشه سه رقم گندم (جدایه های PxW۱، PxW۲ و PxW۳) جداسازی و با استفاده از آزمایش فنوتیپی، شامل طیف سنجی مادون قرمز تبدیل فوریه (FTIR) و همچنین، آنالیز ژنوتیپی نظیر PCR ژن ۱۶S rDNA، تمام جدایه ها به غیر از جدایه StR۱ Pseudoxanthomonas شناسایی شدند. مقایسه روش های یاد شده نشان داد که دو جدایه برنج PxR۱) و (PxR۲ و همچنین دو جدایه گندم PxW۱) و (PxW۲ به یکدیگر شبیه و جزو یک گونه و آن هم گونه جدیدی از Pseudoxanthomonas محسوب می شوند، در حالی که به نظر می رسد جدایه PxW۳ جزو گونه ای دیگر از این جنس باشد. جدایه StR۱ نیز گونه جدیدی از Stenotrophomonas است. در ابتدا تصور بر این بود که جدایه های مزبور جزو جنس Azospirillum هستند، لذا دو سویه Azospirillum Brasilense Sp۷ (S۱) و Azospirillum lipoferum (S۲) به عنوان سویه های استاندارد انتخاب و با جدایه های مورد مطالعه مقایسه شدند، اما آنالیزهای فنوتیپی و ژنوتیپی تایید کرد که این باکتری ها Azospirillum نیستند. برای نخستین بار در این مطالعه نشان داده شد که Pseudoxanthomonas به صورت اندوفیت در ریشه برنج وجود دارد.

Keywords:

اندوفیت , برنج , گندم , Azospirillum , Pseudoxanthomonas , Stenotrophomonas