مطالعه ساختار و لایه بندی جمعیتی و ارتباط ژنومی هاپلوتیپی صفات کیفی پشم در گوسفندان نژاد زندی
Publish place: Journal of Animal science، Vol: 28، Issue: 2
Publish Year: 1397
Type: Journal paper
Language: Persian
View: 336
This Paper With 12 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- I'm the author of the paper
Export:
Document National Code:
JR_ANIMAL-28-2_014
Index date: 16 May 2021
مطالعه ساختار و لایه بندی جمعیتی و ارتباط ژنومی هاپلوتیپی صفات کیفی پشم در گوسفندان نژاد زندی abstract
زمینه مطالعاتی: شناسایی ژنهای بزرگ اثر، موثر بر صفات مهم اقتصادی یکی از مهم ترین اهداف اصلاح نژادی در پرورش گوسفند است. هدف: این تحقیق به منظور بررسی ساختار و لایهبندی جمعیتی و شناسایی جایگاه ها و ژن های مرتبط با صفات کیفی پشم، از طریق مطالعه ارتباط ژنومی هاپلوتیپی (GWAS) با استفاده از تراشه SNP ژنوم گوسفند (Illumnia SNPChip ۵۰K Beadchip) در یک جمعیت گوسفند زندی بود. روشکار: برای هر دام، صفات کیفی شامل: طول استاپل (SL)، میانگین قطر الیاف (MFD)، ضریب تغییرات قطر الیاف (FDCV) و نسبت الیافی که مساوی یا بیشتر از ۳۰ میکرومتر قطر الیاف (F≥۳۰) پشم اندازه گیری شد. پس از شناسایی اثرات ثابت معنیدار، مطالعه کنترل ژنومیکی (GC) با استفاده از آماره لامبدا و پویش ژنومی در نرم افزار PLINK نسخه ۱.۹۰ با استفاده از مدل خطی معمول (GLM) ارتباط هر یک هاپلوتیپها با صفات کیفی پشم ارزیابی و برای کنترل نرخ اشتباه از تصحیح بنفرونی استفاده شد. نتایج: یافتههای حاصل از کنترل ژنومیک لایهبندی ضعیفی برای صفات کیفی پشم شامل SL، MFD، FDCV و F≥۳۰ نشان داد که حاکی از عدم وجود اختلاط ژنتیکی در جمعیت مورد مطالعه است. دو ناحیه هاپلوتیپی پیشنهادی در داخل ژنهای کاندیدا ERBB۲ و GNASواقع شدند که پیشتر به عنوان ژن های موثر بر رشد و توسعه مو و پوست در انسان گزارش گردیده بودند. نتیجهگیری نهایی: ژن های کاندیدای شناسایی شده، عملکرد مولکولی مرتبط با صفات الیاف پشم داشتند. انتخاب برای بهبود کیفی در پشم تولیدی در گوسفندان زندی با استفاده از این یافتهها، باعث تسریع در پیشرفت ژنتیکی خواهد گردید.
مطالعه ساختار و لایه بندی جمعیتی و ارتباط ژنومی هاپلوتیپی صفات کیفی پشم در گوسفندان نژاد زندی Keywords:
مطالعه ساختار و لایه بندی جمعیتی و ارتباط ژنومی هاپلوتیپی صفات کیفی پشم در گوسفندان نژاد زندی authors
حسین محمدی
گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز
سید عباس رافت
گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز
حسین مرادی شهر بابک
گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی کرج، دانشگاه تهران
جلیل شجاع
گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز
محمد حسین مرادی
گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه اراک
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :