بررسی ساختار ژنتیکی و تجزیه فیلوژنتیکی گوزن قرمز ایران بر اساس ناحیه D-Loop میتوکندری
Publish place: Journal of Animal science، Vol: 29، Issue: 4
Publish Year: 1398
Type: Journal paper
Language: Persian
View: 276
This Paper With 17 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- I'm the author of the paper
Export:
Document National Code:
JR_ANIMAL-29-4_002
Index date: 16 May 2021
بررسی ساختار ژنتیکی و تجزیه فیلوژنتیکی گوزن قرمز ایران بر اساس ناحیه D-Loop میتوکندری abstract
زمینه مطالعاتی: آنالیز ژنتیکی جمعیتهای وحشی برای حفظ تنوع زیستی و افزایش دانش در مورد بقای این گونهها و یافتن عوامل تهدید کننده و یا کمک کننده در حفظ این جمعیت مهم و ضروری میباشد. هدف: لذا مطالعه حاضر برای شناسایی توده ژنتیکی موجود، بررسی چگونگی روابط، شکلگیری و تنوع ژنتیکی مارالهای ایرانی با بهرهگیری از اطلاعات توالی ناحیه D-Loop از ژنوم میتوکندریایی انجام شد. روش کار: جهت انجام پژوهش حاضر نمونههای خون، مو یا بافت ۷۸ راس مارال اخذ و DNA آنها استخراج گردید. ناحیه D-Loop از ژنوم میتوکندریایی با استفاده آغازگرهای اختصاصی با روش PCR تکثیر شده و تمامی محصولات PCR توالییابی گردید. سپس توالیهای مورد نظر با استفاده از نرم افزارهای BioEdit جهت بررسی تنوع نوکلئوتیدی همتراز شد، با استفاده از نرم افزار Mega ، درخت فیلوژنتیکی رسم گردید. توالیهای مارال با استفاده از نرم افزار DnaSp آنالیزشد. نتایج: نتایج حاصل منجر به شناسایی جهشهایی گردید که به ایجاد ۵ هاپلوتیپ برای ناحیه D-Loop منتهی شد و تنوع هاپلوتیپی، تنوع نوکلئوتیدی و متوسط تفاوت نوکلئوتیدی برای ناحیه D-Loop به ترتیب ۲۱۸/۰ ، ۰۰۰۷/۰ و ۴۹۱/۰ بهدست آمد. شاخصهای تنوع ژنتیکی نشان داد که شش جمعیت مورد بررسی مارال احتمالا تجربه باتل نک را پشت سر گذاشته است. نتیجهگیری: در پرتو نتایج حاصل از تجزیه و تحلیل جمعیتها از این هاپلوتیپها ، میتوان نتیجهگیری کرد که نوسانات اخیر در اندازه جمعیت و وقفه در جریان ژن به دلیل انتقال گوزنهای قرمز یک جمعیت به سایر زیستگاهها در گذشته باشد.
بررسی ساختار ژنتیکی و تجزیه فیلوژنتیکی گوزن قرمز ایران بر اساس ناحیه D-Loop میتوکندری Keywords:
بررسی ساختار ژنتیکی و تجزیه فیلوژنتیکی گوزن قرمز ایران بر اساس ناحیه D-Loop میتوکندری authors
لیلا آقازاده
گروه علوم دامی دانشگاه محقق اردبیلی
سعید نیک بین
گروه علوم دامی دانشگاه محقق اردبیلی
فرزاد میرزایی آقجه قشلاق
گروه علوم دامی دانشگاه محقق اردبیلی
نعمت هدایت ایوریق
گروه علوم دامی دانشگاه محقق اردبیلی
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :