ارزیابی قابلیت نشانگرهای رتروترانسپوزون در بررسی تنوع ژنتیکی برخی جمعیت های تربچه

مصطفی طباطبایی; فاطمه حدادی; حسین کمال الدینی; بهمن فاضلی نسب

ارزیابی قابلیت نشانگرهای رتروترانسپوزون در بررسی تنوع ژنتیکی برخی جمعیت های تربچه

Publish place: Journal of Crop Breeding، Vol: 10، Issue: 28

Publish Year: 1397

Type: Journal paper

Language: Persian

This Paper With 11 Page And PDF Format Ready To Download

DOWNLOAD Paper

Certificate
I'm the author of the paper

Export:

Link to this Paper:

https://civilica.com/doc/1284659

Document National Code:

JR_JCB-10-28_003

Index date: 9 October 2021

ارزیابی قابلیت نشانگرهای رتروترانسپوزون در بررسی تنوع ژنتیکی برخی جمعیت های تربچه abstract

تربچه از تیره شب بویان، دارای موادی از جمله سنوول، مالوین کلراید، ساپوژنین، سولفورافان و رافانین بوده و از خواص درمانی متعددی برخوردار است. در تحقیق حاضر تنوع ژنتیکی ۷ جمعیت تجاری/بومی گیاه دارویی تربچه با استفاده از نشانگر رتروترانسپوزونی IRAP بررسی شد. آغازگر ترکیبی LTR۲ & LTR۱۵ با ۱ باند کمترین تعداد و آغازگر LTR۲۳ با ۱۶ باند بیشترین تعداد را در میان باندهای تولیدی توسط هر آغازگر داشتند. میانگین تعداد باند در کل جایگاه ها برابر ۹۳/۶ بود. بیشترین میزان شاخص چندشکلی (۴۱/۰) مربوط به آغازگر Sukkula و کمترین میزان شاخص چندشکلی (۱۸/۰) مربوط به آغازگر LTR۲- LTR۱۵ و با میانگین کل ۲۸/۰ مشاهده گردید. بیشترین میزان شاخص نشانگری (۱/۴) مربوط به آغازگر LTR۳ و کمترین میزان شاخص نشانگری (۱۸/۰) مربوط به ترکیب آغازگری LTR۱۵ & LTR۲ مشاهده گردید. بیشترین میزان تعداد باند موثره، شاخص تنوع شانن و شاخص تنوع نی به ترتیب ۸۲/۱، ۶۴/۰ و ۴۵/۰ متعلق به آغازگر Sukkula و کمترین میزان تعداد باند موثره، شاخص تنوع شانن و شاخص تنوع نی به ترتیب ۱۸/۱، ۲۷/۰ و ۱۵/۰ متعلق به آغازگر rtdk بود. در بین جمعیت های تربچه بیشترین درصد مکان چندشکل، تعداد باند موثره، شاخص تنوع نی و شاخص تنوع شانن به ترتیب ۸۵/۴۶، ۰۵/۱، ۱۷/۰ و ۲۶/۰ متعلق به جمعیت Profit بود. تغییرات درون و بین جمعیت ها با استفاده از تجزیه واریانس مولکولی نشان داد که ۵۹ درصد کل تغییرات ژنتیکی به تنوع درون جمعیت ها اختصاص داشت. نتایج این تحقیق نشان داد که می توان از جمعیت Profit (چون دارای بیشترین درصد چندشکلی و تنوع شانن و نی و تعداد باند موثره بوده) به عنوان یکی از پایه های پدری یا مادری و یا دهنده ژن انتخاب در اصلاح تربچه های ایران استفاده کرد.

ارزیابی قابلیت نشانگرهای رتروترانسپوزون در بررسی تنوع ژنتیکی برخی جمعیت های تربچه Keywords:

Genetic Diversity , Genetic similarity , IRAP , Radish , تنوع ژنتیکی , شباهت ژنتیکی , IRAP , Raphanus sativus

ارزیابی قابلیت نشانگرهای رتروترانسپوزون در بررسی تنوع ژنتیکی برخی جمعیت های تربچه authors

University of Zabol

University of Zabol

University of Zabol

University of Zabol

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :

Aalami, A. and N. Karami. ۲۰۱۷. The Study of Genetic ...

Abdollahi Mandoulakani, B., Y. Piri, R. Darvishzadeh, I. Bernoosi and ...

Abdollahi Mandoulakani, B., E. Yaniv, R. Kalendar, D. Raats, H. ...

Alikhani, L., M.-S. Rahmani, N. Shabanian, H. Badakhshan and A. ...

Antonius-Klemola, K., R. Kalendar and A. H. Schulman. ۲۰۰۶. TRIM ...

Asadkhani Mamaghani, R., S. A. Mohammadi and S. Aharizad. ۲۰۱۵. ...

Bahari, Z., A. Shojaeiyan, S. Rashidi Monfared, A. Mirshekari, K. ...

Biswas, M. K., Q. Xu and X.-x. Deng. ۲۰۱۰. Utility ...

Boronnikova, S. V. and R. N. Kalendar. ۲۰۱۰. Using IRAP ...

Branco, C. J., E. A. Vieira, G. Malone, M. M. ...

Campbell, L. G. ۲۰۰۷. Rapid evolution in a crop-weed complex ...

D'Onofrio, C., G. De Lorenzis, T. Giordani, L. Natali, A. ...

Daei Hasani, B., M. Abedini, A. Hemati and S. Falahati. ...

Dalvand, K. and A. Eftekhari. ۲۰۱۴. Evaluation of Cadmium Uptake ...

Dellaporta, S. L., J. Wood and J. B. Hicks. ۱۹۸۳. ...

Djebali, N., J. K. Scott, M. Jourdan and T. Souissi. ...

Drikvand, R., M. R. Bihamta, G. Najafian and A. Ebrahimi. ...

Eivazi, A., M. Naghavi, M. Hajheidari, S. Pirseyedi, M. Ghaffari, ...

Fazeli-Nasab, B., A. A. Mehrabi and A. Izadi-Darbandi. ۲۰۱۰. Genetic ...

Gautam Murty, S., F. Patel, B. Punwar, M. Patel, A. ...

Guo, Z.-H., K.-X. Fu, X.-Q. Zhang, S.-Q. Bai, Y. Fan, ...

Hashemi, H. and A. Safarnejad. ۲۰۱۰. The use of RAPD ...

Hassani-Tesie, S. F., H. Samizadeh-Lahiji and M. Shoaei-Deilami. ۲۰۱۶. Assessment ...

Jaccard, P. ۱۹۱۲. The distribution of the flora in the ...

Jamalirad, S., S. Mohammadi and M. Toorchi. ۲۰۱۲. Assessing genetic ...

Kalendar, R., T. Grob, M. Regina, A. Suoniemi and A. ...

Kalendar, R. and A. H. Schulman. ۲۰۰۶. IRAP and REMAP ...

Kameli, M., S. Hesamzadeh and M. Ebadi. ۲۰۱۳. Assessment of ...

Khaled, A., M. Motawea and A. Said. ۲۰۱۵. Identification of ...

Lewontin, R. C. ۱۹۷۲. The apportionment of human diversity, pp. ...

Manninen, O., R. Kalendar, J. Robinson and A. H. Schulman. ...

Mir-Drikvand, R., A. Khyrolahi, A. Ebrahimi and M. Rezvani. ۲۰۱۵. ...

Mohammadi, S. and B. Prasanna. ۲۰۰۳. Analysis of genetic diversity ...

Momeni, H., B. Shiran, M. Khodambashi and K. Cheghamirzaei. ۲۰۱۳. ...

Momeni, S., B. Shiran and K. Razmjoo. ۲۰۰۶. Genetic variation ...

Monden, Y., K. Yamaguchi and M. Tahara. ۲۰۱۴. Application of ...

Nasri, S., B. A. Mandoulakani, R. Darvishzadeh and I. Bernousi. ...

Nei, M. ۱۹۷۳. Analysis of gene diversity in subdivided populations. ...

Nei, M. and W.-H. Li. ۱۹۷۹. Mathematical model for studying ...

Nguyen, T. X., S.-I. Lee, R. Rai, N.-S. Kim and ...

Olfati, J. A., H. Samizade, G. A. Peyvast, B. Rabiei ...

Pejmanmehr, M., M. A. Hasani, S. M. Fakhr-Tabatabai and J. ...

Petrovičová, L., Ž. Balážová, Z. Gálová, M. Wójcik-Jagła and M. ...

Prasad, M., R. Varshney, J. Roy, H. Balyan and P. ...

Rao, V. R. and T. Hodgkin. ۲۰۰۲. Genetic diversity and ...

Rauf, S., J. Teixeira da Silva, A. A. Khan and ...

Roder, M. S., J. Plaschke, S. U. König, A. Börner, ...

Rodrigues, V. F., R. R. Oliveira and M. R. Vega. ...

Rolf, F. J. ۲۰۰۲. NTSYS-Pc: Reference Manual. Exeter publishing Ltd. ...

Sabot, F. and A. H. Schulman. ۲۰۰۷. Template switching can ...

Saini, M., S. Singh, Z. Hussain and A. Yadav. ۲۰۱۰. ...

Singh, P. and J. Singh. ۲۰۱۳. Medicinal and therapeutic utilities ...

Smýkal, P., N. Bačová-Kerteszová, R. Kalendar, J. Corander, A. H. ...

Solouki, M., S. Hoseini, B. Siahsar and A. Tavassoli. ۲۰۱۲. ...

Suresh, S., J.-W. Chung, J.-S. Sung, G.-T. Cho, J.-H. Park, ...

Teo, C. H., S. H. Tan, C. L. Ho, Q. ...

Venturi, S., L. Dondini, P. Donini and S. Sansavini. ۲۰۰۶. ...

Vicient, C. M., R. Kalendar and A. H. Schulman. ۲۰۰۵. ...

Vukich, M., A. H. Schulman, T. Giordani, L. Natali, R. ...

Yuying, S., D. Xiajun, W. Fei, C. Binhua, G. Zhihong ...