گروه بندی و بررسی الگوی بیان ژن های خانواده bZIP در ریشه گیاه گوجه فرنگی تحت تنش دمای پایین
Publish place: Journal of Crop Breeding، Vol: 8، Issue: 17
Publish Year: 1395
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 161
This Paper With 7 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_JCB-8-17_003
تاریخ نمایه سازی: 17 مهر 1400
Abstract:
bZIP یکی از مهمترین عوامل رونویسی هستند که در اکثر تنشها فعال هستند و باعث بیان و تنظیم تعدادی زیادی ژن در طی تنشهای محیطی میشوند. گیاه گوجه فرنگی دارای ۷۳ ژن bZIP است که تاکنون این ژنها گروهبندی نشدهاند. در این تحقیق با استفاده از مطالعه نواحی فعالیت و اتصال به DNA، این خانواده بزرگ از عوامل رونویسی گروهبندی گردید. نتایج گروهبندی نشان داد که bZIPs گوجهفرنگی طبق عملکرد و میزان همولوژی با ژنهای bZIP آرابیدوپسیس در یازده گروه قرار میگیرند. سه ژن Solyc۰۶g۰۷۴۳۲۰، Solyc۰۱g۱۰۹۸۸۰ و Solyc۱۰g۰۸۵۲۱۰ به ترتیب از گروههای D، I و B برای مطالعه بیان ژن تحت تنش دمای پایین انتخاب شدند. دو ژنوتیپ حساس به سرما (Moneymaker) و مقاوم به سرما (LA۱۷۷۷) گیاه گوجه فرنگی در مرحله گیاهچهای تحت شرایط دمای نرمال (۲۳ درجه سانتیگراد) و دمای پایین (۱۵ درجه سانتیگراد) برای مطالعه بیان ژن در ریشه کشت گردیدند. نتایج نشان داد که ژن Solyc۰۶g۰۷۴۳۲۰ کمتر از Solyc۰۱g۱۰۹۸۸۰ و Solyc۱۰g۰۸۵۲۱۰ تحت تنش دمای پایین در ریشه گیاه گوجهفرنگی القاء میشود. نتایج این بررسی میتواند نقطه شروعی برای مطالعه عملکردی ژنهای خانواده bZIP در آینده باشد.
Keywords:
Classification , Gene expression , Low temperature , Tomato , Transcription factor , تنش دمای پایین , عوامل رونویسی , گوجه فرنگی , بیان ژن , کلاس بندی ژن ها
Authors
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :