بهینه سازی استخراجDNA از نمونه های جانوری موزه ای و قدیمی شامل پوست و استخوان پستانداران با روش اصلاحی فنل کلروفرم ( مطالعه موردی: فوک خزر)
Publish place: Journal of Animal Environment، Vol: 12، Issue: 4
Publish Year: 1399
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 220
This Paper With 9 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_AEJO-12-4_004
تاریخ نمایه سازی: 12 آبان 1400
Abstract:
امروزه مطالعه DNA نمونه های موزه ای به دلیل اطلاعات مفیدی که دراختیار محققان قرار می دهد، از اهمیت خاصی برخوردار است. علاوه بر این، از آن جا که محتوای ژنتیکی این نمونه ها به دلیل مرور زمان بسیار شکننده و بعضا غلظت شان نیز بسیار اندک است، از گذشته تاکنون نیاز به روش های موثرتر همراه با بازدهی بالاتری برای استخراج کمی و کیفی مطلوب احساس می شد. از این رو محققان بسته به گونه یا بافت هدف، اغلب با اصلاح و بهینه سازی پروتکل های استخراج به دنبال یافتن روش مناسبی برای تحقق اهداف شان هستند. در این مطالعه با تغییر بعضی پارامترها در روش فنول کلروفرم محتوای ژنتیکی تعداد ۲۲ نمونه فوک خزری که شامل بافت های تازه و نمونه های موزه ای بودند استخراج گردید. هم چنین میانگین غلظت DNA بافت های تازه و نمونه های موزه ای براساس میانگین و اشتباه معیار (M±SE) به ترتیب برابر با ۱۸۲/۹۱±۶۳۲/۹۰ و ۷۵/۶۲±۲۲۶/۸۷ نانوگرم بر میکرولیتر و میانگین نسبت جذبی طول موج ۲۶۰ به ۲۸۰ نانومتر در نمونه های تازه به ۱/۸ نزدیک تر بود. محصول DNA نمونه های حاصل از بافت عضله تازه به طور معنی داری از غلظت بالاتری برخوردار بودند. سپس DNA حاصل با استفاده از دو آغازگر اختصاصی فوک خزری (Hg۶.۳ و Hg۸.۹) با واکنش زنجیره ای پلی مراز پس از رسیدن به گرادیان دمایی مطلوب تکثیر شدند. نتایج حاصل از مستند سازی باندهای مولکولی بر روی ژل آکریل آمید ۸ درصد، حاکی از موفقیت آمیز بودن تکثیر همه نمونه ها اعم از بافت های تازه و نمونه های موزه ای با حداقل ۲ دهه قدمت بود. باتوجه به قابلیت ژنوتایپ موفق برای مطالعات ژنتیک جمعیت، حفظ نمونه های موزه ای تحت هر شرایطی توصیه می شود.
Keywords:
Authors
آریا خزاعی
گروه محیط زیست، دانشکده منابع طبیعی و علوم دریایی، دانشگاه تربیت مدرس، نور، ایران
سید محمود قاسمپوری
گروه محیط زیست، دانشکده منابع طبیعی و علوم دریایی، دانشگاه تربیت مدرس، نور، ایران
امیرصیاد شیرازی
مرکز حفاظت فوک خزری ایران، جزیره آشوراده، بندرترکمن، ایران
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :