اثر ژنوتیپ گیاه و مکان جغرافیایی بر روی فراوانی باکتری اندوفیت متیلوباکتریوم در میوه دو رقم توت فرنگی

اندوفیت به گروهی از میکروارگانیسم ها اطلاق می­گردد که در قسمتهای داخلی بافت­های گیاهان زندگی نموده و بر بسیاری از خصوصیات گیاه میزبان تاثیر می­گذارند. گونه های مختلف باکتری اندوفیت متیلوباکتریوم در سنتز کاراتنوئیدها، تولید ترکیبات فنولی و فرار، همچنین در افزایش سطح تولید اجزای سازنده عطر و طعم در میوه موثر می­باشند. تنوع و فراوانی این باکتری ها تحت تاثیر ژنوتیپ گیاه میزبان، شرایط اقلیمی و خاک می باشد. این مطالعه به منظور جداسازی باکتری های جنس متیلوباکتریوم از دو رقم توت فرنگی در مناطق مختلف استان کردستان انجام شد. در این پژوهش باکتری های اندوفیت از میوه دو رقم توت فرنگی کردستان و پاروس جمع­آوری شده از سه منطقه انگوژان، گاورود و نشور در استان کردستان جداسازی شدند. شناسایی جدایه های باکتری براساس تعیین توالی ژن  ۱۶S rDNA انجام گردید. بدین منظور پس از استخراج DNA ژنومی جدایه­ها، ژن ۱۶S rDNA به روش PCR تکثیر و پس از تعیین توالی میزان شباهت توالی­های به دست آمده با توالی نوکلئوتیدی ژن ۱۶S rDNA سایر باکتری های مرجع با استفاده از نرم افزار Blastn محاسبه گردید. سپس جمعیت جدایه­های باکتری در زمان های (مراحل) مختلف رسیدگی میوه تعیین گردید. نتایج به دست آمده نشان داد که باکتری جدا شده در هر دو رقم کردستان و پاروس متعلق به جنس متیلوباکتریوم (Methylobacterium) می باشد. جمعیت باکتری های متیلوباکتریوم در ارقام مورد مطالعه در مناطق مشابه از لحاظ آماری متفاوت بود. رقم کردستان در مقایسه با رقم پاروس، در هر سه منطقه برتری معنی داری از لحاظ جمعیت باکتری نشان داد (p< ۰.۰۵). بیشترین جمعیت باکتری در هر دو رقم و در مناطق جغرافیایی مورد مطالعه در مرحله رسیدگی میوه محاسبه گردید. با توجه به تفاوت دو رقم گیاه از لحاظ عطر و طعم و همچنین تفاوت معنی دار جمعیت باکتری احتمال تاثیر این باکتری ها در عطر و طعم این دو رقم وجود دارد.

اثر ژنوتیپ گیاه و مکان جغرافیایی بر روی فراوانی باکتری اندوفیت متیلوباکتریوم در میوه دو رقم توت فرنگی Keywords:

باکتری اندوفیت , توت فرنگی , پاروس , کردستان , ۱۶S rDNA