تنوع ژنوتیپی جدایه‎های tumefaciens Agrobacterium و A. vitis از میزبان های مختلف در برخی از استان های غربی و جنوبی ایران با استفاده از نشانگر RAPD

Publish Year: 1396
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 163

This Paper With 21 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

JR_IJPP-53-2_004

تاریخ نمایه سازی: 18 اسفند 1400

Abstract:

به منظور بررسی تنوع ژنتیکی گونه­های  tumefaciens Agrobacterium و A.vitis در سال­های ۹۳-۱۳۹۲ از باغ‎های مو، گلخانه های پرورش گل رز و مزارع چغندر قند در استان­ جنوبی (فارس) ، جنوب غربی(کهکیلویه و بویراحمد) و غربی (کردستان و کرمانشاه)، از گیاهان دارای علائم گال طوقه و ریشه نمونه برداری صورت گرفت. بر اساس ویژگی‎های فنوتیپی، آزمون­های بیو شیمیایی، بیماری­زایی و همچنین با استفاده از آغازگرهای عمومی جنس (virD۲A/virD۲C) و اختصاصی در سطح گونه (VCF/VCR و PGF/PGR) بیمارگر به عنوان، tumefaciens A. و A.vitis  شناسایی شد. علاوه بر این با استفاده از جفت آغازگرهای  VisF/VisRو VisFF۱/R۲ نوع اوپین جدایه های A.vitis تشخیص داده شد. جهت بررسی تنوع ژنتیکی بین جدایه­های دو گونه tumefaciens. A و A.vitis در آزمون چندشکلی تصادفی قطعات تکثیر شده­ی دی­ان­ای (RAPD) از ۱۱ آغازگر تصادفی استفاده شد. در گونه tumefaciens. A جدایه های متعلق به میزبان های مختلف در سطح تشابه ۷۳ درصد به سه گروه و جدایه های A.vitis به دو گروه  تقسیم شدند. نتایج نشان داد که جدایه های متعلق به دو گونه tumefaciens. A و A.vitis دارای تنوع زیادی بودند و جدایه­های به دست آمده از یک منطقه­ جغرافیایی در چند گروه مختلف قرار گرفتند. همچنین بین تنوع ژنتیکی جدایه­های مورد بررسی و منطقه­ جغرافیایی یا میزبان آن­ها ارتباطی وجود نداشت .با استفاده از آغازگرهای VisF/VisRو VisFF۱/R۲ مشخص شد  که ۹/۵۷ درصد از جدایه­های A.vitis دارای ژن کد کننده ویتوپین، ۳/۲۶ درصد از جدایه دارای ژن کد کننده اوپین اکتوپین / نوپالین  بودند و ۸/۱۵ درصد جدایه­ها قادر به تکثیر هیچ یک از قطعات ذکر شده نبودند

Authors

حمزه مفاخری

به ترتیب دانش آموخته کارشناسی ارشد بیماری شناسی گیاهی ،استادو استاد بیماری شناسی گیاهی دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز

سیدمحسن تقوی

به ترتیب دانش آموخته کارشناسی ارشد بیماری شناسی گیاهی ،استادو استاد بیماری شناسی گیاهی دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز

ضیاالدین بنی هاشمی

به ترتیب دانش آموخته کارشناسی ارشد بیماری شناسی گیاهی ،استادو استاد بیماری شناسی گیاهی دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز

علی نیازی

دانشیار پژوهشکده بیوتکنولوژی دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • Ale-Yasin S.K. and Banihashemi Z. ۱۹۹۳. Isolation of causal agent ...
  • Amani B. ۱۹۶۶. Crown gall of grapevine. Iranian Journal of ...
  • Arabi F., Nikravesh Z ., Rezaeian V. and Rahimian H. ...
  • Costechareyre D., Rhouma A., Lavire C ., Portier P ., ...
  • De Cleene M. and De Ley J. ۱۹۷۶. The host ...
  • Fatehi R., Mohammadi M., Rahimian H., Sharifi-Tehrani A. and Zakeri ...
  • Haas J.H., Moore L.W., Ream W. and Manulis S. ۱۹۹۵. ...
  • Irani H. and Ghasemi A. ۲۰۰۴. Isolation of Agrobacterium tumefaciens ...
  • Irelan N. A. and Meredith C. P. ۱۹۹۶. Genetic analysis ...
  • Javaheri M., Mohammadi H., Rahimian H. and Sharifi-Tehrani. ۲۰۰۰. Detection ...
  • Kawaguchi A., Sawada H. and Ichinose Y. ۲۰۰۸.Phylogenetic and serological ...
  • Knauf V., Panagopoulos C. and Nester E. ۱۹۸۲. Genetic factors ...
  • Kuzmanovic N ., Ivanovic M., Prokic A., Gasic K., Zlatkovic ...
  • Llop P., Lastra B., Marsal H., Murillo J. and López ...
  • Mafakheri H, Taghavi S. M, Banihashemi Z, Osdaghi E . ...
  • Maki-Valkama T. and Karjalainen R.۱۹۹۴. Differentiation of Erwinia carotovora subsp. ...
  • Mareft A.S. and Hassanzadeh N. ۱۹۹۸. Bacterial crown gall in ...
  • Momol E., Burr T., Reid C., Momol M., Hseu S. ...
  • Moore L.W., Bouzar H . and Burr T.J. ۲۰۰۱. Gram-negative ...
  • Naghavi M. R., Ghariazi B. and Hosseini Salekdeh.۲۰۰۷. Molecular Marker. ...
  • Niknezhad Kazempour M., Roustaei A. and Rezaei M . ۲۰۰۷. ...
  • Pooler M.R . and Hartung J.S . ۱۹۹۵. Genetic relationships ...
  • Puławska J. ۲۰۱۰. Crown gall of stone fruits and nuts, ...
  • Puławska J. and Kałużna M. ۲۰۱۱ . Phylogenetic relationship and ...
  • Rademaker J. L. W., and de Bruijn F. J. ۱۹۹۷. ...
  • Rouhrazi K. and Rahimian H. ۲۰۱۲. Genetic diversity of Iranian ...
  • Rouhrazia K. ۲۰۱۱. Determination of Rhizobium species and heterogeneity of ...
  • Safdari M, Rahimian H, Hejazi MA. and Barzegari A . ...
  • Salahi Ardekani A ., Taghavi S.M. and Banihashemi Z. ۲۰۰۰. ...
  • Salehi S., Ghasemi A., Rahimian H. and Nazeriyan I. ۲۰۰۳.Occerence ...
  • Salehi S., Rahimian H. and Ghasemi A. ۲۰۰۶. Diversity of ...
  • Schaad N.W., Jones J.B. and Chun W. ۲۰۰۱ . Laboratory ...
  • SefcK M., Lefort F., Grando S., Scott K.D., Steinkellner H. ...
  • Shahabi Mohammad Abadi M., Taghavi S.M. and Djavaheri M. ۲۰۱۲. ...
  • Shams M. ۲۰۱۲. Assessing the diversity of agrobacterial populations. PhD ...
  • Szegedi E. and Bottka S. ۲۰۰۲. Detection of Agrobacterium vitis ...
  • Szegedi E . ۲۰۰۳. Opines in naturally infected grapevine crown ...
  • Tzfira T. and Citovsky V. ۲۰۰۸. Agrobacterium: from Biology to ...
  • Xu, Y., M. Rong-Cai, H. Xie and C. Ming-Qing. ۲۰۰۴. ...
  • Young J.M., Pennycook S.R . and Watson D.R. ۲۰۰۶. Proposal ...
  • نمایش کامل مراجع