ارزیابی تنوع ژنتیکی جدایه های مخمری عامل شانکر درختان میوه هسته دار در برخی از استان های مرکزی ایران

چکیده شانکر یکی از خسارت زاترین بیماری های درختان میوه هسته دار است که سبب ایجاد زخم های فرورفته تیره رنگ همراه با تراوش صمغ بر روی سرشاخه ها، شاخه ها و تنه درختان آلوده می شود. بیماری از مناطق مختلفی از ایران گزارش شده و نشان داده شده است که عمدتا توسط Pseudomonas   syringae   pv.  syringaeو در موارد کمتری به وسیلهXanthomonas   arboricola  pv.  pruniایجاد می شود. برای ارزیابی پراکندگی عوامل بیماری، نمونه هایی از درختان آلوده باغ های استان های اصفهان، چهارمحال و بختیاری، قم و یزد جمع آوری گردید. بخش های دارای علائم شاخه ها پس از ضد عفونی سطحی، در آب مقطر استریل خرد شده و سوسپانسیون به دست آمده روی محیط آگار غذایی حاوی سوکروز کشت گردید. کلونی های غالب روی محیط یاد شده برجسته، سفید مایل به خاکستری و خمیری شکل بودند. بیماریزایی نماینده هایی از جدایه ها روی نهال های هلو (Prunus persica) به اثبات رسید. DNA ژنومی از نماینده ها استخراج و قطعه ای از ژن RNA ریبوزومی ۲۶S آن ها با PCR تکثیر و توالی یابی گردید. مقایسه توالی این ناحیه با توالی های مشابه در ژن بانک نشانگر تشابه بالای آن ها با گونه های Cryptococcus بود. تنوع ژنتیکی بیست و هفت جدایه به دست آمده با یکدیگر و با دو جدایه مرجع Cryptococcus adeliensisوC. magnus با به کارگیری آغازگرهای ERIC، BOX و REP بررسی شد. در دندروگرام رسم شده بر پایه تجمیع نتایج حاصل از سه نشانگر، جدایه ها در سطح تشابه ۳۰% در ۱۲ گروه قرار گرفتند. نتایج نشانگر وجود تنوع قابل توجه در بین جدایه های عامل شانکر درختان میوه هسته دار در مناطق مرکزی ایران است..

Keywords:

آر- ان- آ ریبوزومی , ۲۶S , rep-PCR , شانکر , Cryptococcus