مقایسه پروفایل بیان افتراقی ژن های کاندیدا مرتبط با صفت باروری در گاوهای هلشتاین با استفاده از دیدگاه ترانسکریپتوم و مبتنی بر فناوری RNA-Seq
Publish place: IRANIAN JOURNAL OF ANIMAL SCIENCE، Vol: 52، Issue: 4
Publish Year: 1400
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 163
This Paper With 13 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
این Paper در بخشهای موضوعی زیر دسته بندی شده است:
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_IJAS-52-4_001
تاریخ نمایه سازی: 18 اسفند 1400
Abstract:
انتخاب ژنتیکی برای افزایش تولید شیر و سودآوری اقتصادی در صنعت گاوهای شیری با کاهش عملکرد تولیدمثلی از جمله کاهش زنده مانی رویان و افزایش از دست رفتن آبستنی همراه بوده است. در پژوهش حاضر، هدف اصلی، استفاده از پروفایل ترانسکریپتوم بافت آندومتریوم و جسم زرد دو دسته از گاوهای شیری هلشتاین با باروری بالا و پایین، به منظور شناسایی ژن های موثر در حفظ باروری به ویژه اوایل دوره آبستنی است. در تجزیه داده های RNA-Seq برای مقایسه بیان ژنی، ۴۵۳۸ ژن استخراج شد که در مجموع ۱۴۶۶ ژن تفاوت بیانی معنی داری نشان دادند (P<۰.۰۰۰۰۰۱, Fold change<۰.۵). سپس با مقایسه ژن های مربوطه در میان پروفایل های ترانسکریپتوم، ژن های مشترک بین بافت آندومتریوم (روزهای هفت و ۱۳ چرخه فحلی) و جسم زرد (در روز ۱۳ چرخه فحلی) شامل ژنهای SYNM، PARM۱، NXPE۲، NT۵DC۳، COL۴A۳، COL۱۲A۱، ALPK۳، ADAMDEC۱، SERPINA۱۴، S۱۰۰A۹، PI۱۶، OAS۱X، MSTN، MASP۱، CD۸۳، CA۲، C۲، C۵، JSP.۱ و SAA۳ مشخص شدند. بررسی نتایج حاشیه نویسی این ژن ها ثابت کرد که در فرآیند اصلی مسیرهای متابولیک و سیگنالینگ مرتبط با سیستم حمل و نقل یونی، التهاب، عملکرد سیستم ایمنی بدن و ساختار ماتریس سلولی دارای نقش می باشند. پژوهش حاضر می تواند بینش جدیدی از شواهد مولکولی در راستای سازوکارهای زیستی پروفایل ترانسکریپتوم در محیط رحم و بیومارکرهای مرتبط با باروری در گاوهای شیری ارائه دهد.
Keywords:
Authors
فرزاد غفوری
دانشجوی دکتری تخصصی، گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج، ایران
مصطفی صادقی
دانشیار، گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج، ایران
ابوالفضل بهرامی
دانش آموخته دکتری، گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج، ایران
رستم عبدالهی آرپناهی
محقق، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی و علوم محیط زیست، دانشگاه جورجیا، جورجیا، ایالات متحده آمریکا
آرش جوانمرد
استادیار، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه تبریز، تبریز، ایران
سید رضا میرائی آشتیانی
استاد، گروه علوم دامی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران، کرج، ایران
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :