بازسازی شبکه ژن های هم بیان مرتبط با رشد و تکامل فولیکول های الیاف در جنین بز کرکی

فولیکول مو قسمتی از پوست است که مو را تولید و چرخه رشد مو را کنترل می کند. فولیکول مو مرکزی برای رشد الیاف مهم از نظر اقتصادی در صنعت دامپروری است. مطالعات نشان داده اند که تغییرات در سطح بیان ژن ها در رشد و نمو فولیکول مو تاثیر دارد. با وجود پیشرفت های اخیر در شناسایی شبکه های هم بیانی ژن ها و سیگنال های مولکولی که بر توسعه پوست و رشد فولیکول مو حاکم است، مکانیسم های تنظیم کننده ساخت الیاف بز کرکی، هنوز شناسایی نشده است. از این رو، پژوهش کنونی برای بررسی مهمترین مولکول­های کنترل کننده رشد و نمو فولیکول­های الیاف در بز کرکی و رمزگشایی ژن های درگیر در رشد و نمو فولیکول های الیاف انجام شد. به این منظور، از داده­های مربوط به توالی یابی رونوشت های پوست جنین بزهای کرکی شانبی در سه مرحله رشد استفاده شد. آنالیز بیان افتراقی رونوشت ها نشان داد که در تمام طول روند رشد فولیکول  بیان ۱۴۵ ژن افزایش و بیان ۶۵۰ ژن کاهش داشته است. از بین ژن هایی با بیان افتراقی، ژن­های تنظیمی هم بیان بر اساس نتایج واکاوی پارامترهای آماری شبکه و مستند سازی کارکردی شناسایی شدند که شامل: SHH، KLF۴، MMP۹،MSX۱، KRT۱۷ ، COL۲A۱و VEGFA بودند. بر اساس نتایج حاصل از پژوهش کنونی ژن هایی با اثرات عمده شناسایی شدند که تنظیم کننده شبکه های بیانی ژن ها و سیگنال های مولکولی مرتبط با ساخت الیاف بز کرکی هستند. این ژن ها با توجه به  مستند سازی عملکردی می توانند نقش قابل توجهی در بهبود اصلاح نژاد بز کرکی ایفا کنند.

Keywords:

آنالیز رونوشت , الیاف بز کرکی , بیان افتراقی , شبکه تنظیمی بیان