بررسی اثر ژن های مرتبط با میتوپروتئوم بر رشد ماهیچه سینه مرغ بومی اصفهان به وسیله داده RNA-seq

این آزمایش به منظور بررسی و شناسایی تفاوت های ژنتیکی و مسیرهای متابولیکی مرتبط با میتوکندری بین توده مرغ بومی اصفهان و یک سویه جوجه تجاری راس ۷۰۸ با سرعت رشدهای متفاوت، انجام شد. بدین منظور از روش توالی یابی RNA-seq با استفاده از چهار نمونه ماهیچه سینه ۲۸ روزگی استفاده شد. مقایسه آماری بیان ژن های توالی یابی شده در مرغ بومی و جوجه تجاری، ۶۰۶ ژن با تفاوت معنی دار را مشخص نمود و از این تعداد ۲۴۹ ژن در مرغ بومی و ۳۵۷ ژن در جوجه تجاری افزایش بیان داشتند. بر اساس نتایج بیان ژن ها در مرغ بومی، فاکتور رونویسی FoxO۳ موجب فعال شدن مسیر آتروفی لیگازهای یوبیکویتینی E۳ و افزایش شکست پروتئین و در نتیجه کاهش حجم ماهیچه اسکلتی در مقایسه با جوجه تجاری شده است. هیپوکسی و تنظیم فرآیند متابولیکی گونه های اکسیژن فعال (ROS) از مهم ترین فرآیندهای بیولوژیکی فعال در مرغ بومی بودند. بررسی و مقایسه ژن های مرتبط با پروتئوم میتوکندریایی نشان داد در این مرغ تغییرات معنی داری در بیان بسیاری از پروتئین های وابسته به رشد و تنظیم کننده رونویسی وجود دارد. این تغییرات نشان دهنده برنامه سازگاری پیچیده ای است که شکست پروتئین را تسهیل نموده و سوخت گلوکز در ماهیچه را کاهش می دهد. این مسیرهای متابولیسمی در جهت کاستن سطح نیازمندی های مرغ بومی به گونه ای تکامل یافته اند تا توان این مرغ را در غلبه بر شرایط و تنش های محیطی و تحمل کمبودهای غذایی تقویت نمایند.

Keywords:

ماهیچه سینه , مرغ بومی , میتوپروتئوم , RNA-seq