تنوع آللی، ساختار جمعیت و تنوع ژنتیکی ژنوتیپ های مختلف خرما (Phoenix dactylifera L.) با استفاده از نشانگر آی. اس. اس. آر

Publish Year: 1400
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 372

This Paper With 20 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JOAGK-14-1_008

تاریخ نمایه سازی: 30 فروردین 1401

Abstract:

هدف: نخل خرما یکی از مهمترین درختان مناطق خشک و گرمسیری با میوه بسیار ارزشمند به عنوان یک منبع غذایی خوب می باشد. لذا هدف از این مطالعه بررسی ساختار جمعیت و تنوع ژنتیکی ژنوتیپ های مهم خرما با استفاده از نشانگر مولکولی ISSR جهت استفاده در مطالعات ژنومیک است. مواد و روش ها: DNA ژنومی از بافت برگ ۶۸ ژنوتیپ خرما با استفاده از روش ژانگ و همکاران استخراج شد. ارزیابی کمیت و کیفیتDNA  استخراج شده با استفاده از دستگاه اسپکتروفتومتر انجام شد به منظور ارزیابی کیفی، نمونه های DNA روی ژل آگارز ۲ درصد نیز مورد بررسی قرار گرفتند. واکنش زنچیره ای پلیمراز با استفاده از ۱۰ نشانگر ISSR انجام شد. نتایج: در این مطالعه ۷۴ باند چند شکل ایجاد شد که به طور متوسط ۷۸/۶۵ درصد چند شکلی نشان دادند. بر اساس نتایج این آزمایش نشانگرهای (AG)۸YC'، (TC)۸C و (GA)۸C به عنوان نشانگرهای مناسب در بررسی تنوع ژنتیکی خرما می باشند. تجزیه ساختار جمعیت مورد بررسی را به سه زیر ساختار تقسیم نمود. نتایج حاصل از تجزیه واریانس مولکولی بین و داخل سه زیرجمعیت نشان داد که سهم واریانس درون و بین زیر جمعیت ها به ترتیب ۷۹ و ۲۱ درصد از واریانس کل بود. تجزیه به مولفه های اصلی بر پایه ماتریس فاصله مربع اقلیدسی نشان داد که ده مولفه اول در مجموع ۵۷/۵۴ درصد از کل تغییرات را توجیه نمود و دیاگرام پراکنش جمعیت ها بر اساس دو مولفه اول جمعیت را به چهار گروه تقسیم نمود. تجزیه خوشه ای نیز بر اساس روش الگوبندی اتصال کامل و معیار فاصله اقلیدسی ۶۸ ژنوتیپ خرما به چهار گروه تقسیم بندی کرد. نتیجه گیری: نشانگر ISSR می تواند به عنوان نشانگر مناسب جهت مطالعه در تمایزیابی و تجزیه ساختار جمعیت خرما مفید واقع شود. تنوع ژنتیکی بالا درون و بین زیر جمعیت ها امکان انتخاب والدین اصلاحی در برنامه های به نژادی خرما برای صفات مناسب را فراهم می کند.

Authors

فاطمه ابراهیمی

استادیار/بهنزادی گیاهی پژوهشکده فناوری تولیدات گیاهی/ دانشگاه باهنر کرمان

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • مطالعه تنوع ژنتیکی جمعیت های زنبور عسل استان کرمان با استفاده از نشان گرهای ISSR [مقاله ژورنالی]
  • عسکری ناهید، باقی زاده امین، محمدآبادی محمدرضا (۱۳۸۹) مطالعه تنوع ...
  • عسکری ناهید، محمدآبادی محمدرضا، باقی زاده امین (۱۳۹۰) نشانگرهای ISSR ...
  • موسوی دراز محله سیده مهسا، زین العابدینی مهرشاد، مردی محسن ...
  • Reference ...
  • Alalawi RA, Almashiqri JH, Alnadabi JSM et al. (۲۰۱۷) Date ...
  • Amini F, Saeidi G, Arzani A (۲۰۰۸) Study of genetic ...
  • Askari N, Baghizadeh A, Mohammadabadi MR (۲۰۱۰) Study of genetic ...
  • Askari N, Mohammadabadi MR, Baghizadeh A (۲۰۱۱) ISSR markers for ...
  • Bahador Y, Mohammadabadi MR, Khezri A et al. (۲۰۱۶) Study ...
  • Beal JM (۱۹۳۷) Cytological studies in the genus Phoenix. Bot ...
  • Bekheet SA, Taha HS, Hanafy MS, Solliman ME (۲۰۰۸) Morphogenesis ...
  • Chao CT, Krueger RR (۲۰۰۷) The date palm (Phoenix dactylifera ...
  • Ditta A, Zhou Z, Cai X et al. (۲۰۱۸) Assessment ...
  • Elshibli S, Korpelainen H (۲۰۰۸) Microsatellite markers reveals high genetic ...
  • Esposito MA, Gatti۱ I, Cravero VP et al. (۲۰۱۳) Combining ...
  • Evanno G, Regnaut S, Goudet J (۲۰۰۵) Detecting the number ...
  • Fang Y, Wu H, Zhang T et al. (۲۰۱۲) A ...
  • Hamza H, Abederrahim M, Elbekkay M, Ferchichi A (۲۰۱۳) Comparison ...
  • Hassanzadeh Khankahdani H, Bagheri A (۲۰۱۹) Identification of genetic variation ...
  • Jump AS, Hunt JM, Penuelas J (۲۰۰۶) Rapid climate change-related ...
  • Laurentine H )۲۰۰۹( Data analysis for molecular characterization of plant ...
  • Li Q, Liu QC, Zhai H et al. (۲۰۰۸) Genetic ...
  • Mahasi MJL, Wachira FN, Pathak RS, Riungu TC (۲۰۰۹) Genetic ...
  • Mahjoob BH, Najafi-Zarini Hashemi SHR (۲۰۱۴) Assesment of genetic relationships ...
  • Mohammadabadi MR, Askari N (۲۰۱۲) Characterization of genetic structure using ...
  • Mohammadabadi MR, Esfandyarpoor E, Mousapour A (۲۰۱۷) Using inter simple ...
  • Mohammadabadi MR, Oleshko V, Oleshko O et al. (۲۰۲۱) Using ...
  • Mousavi Derazmahalleh SM, Zeinalabedini M, Mardi M et al. (۲۰۱۴) ...
  • Peakall R, Smouse P (۲۰۱۲) GenAlEx ۶.۵: Genetic analysis in ...
  • Powell W, Morgante M, Andre C et al. (۱۹۹۶) The ...
  • Shannon CE (۱۹۴۸) The mathematical theory of communication. Bell Syst ...
  • Wei YM, Hou YC, Yan ZH et al. (۲۰۰۵) Microsatellite ...
  • Weising K, Nybom H, Wolff K, Kahl G (۲۰۰۵) Applications ...
  • Zamani P, Akhondi M, Mohammadabadi MR (۲۰۱۵) Associations of inter-simple ...
  • Zhang YP, Uyemoto JK, Kirkpatrick BC (۱۹۹۸) A small-scale procedure ...
  • نمایش کامل مراجع