شناسایی و غربالگری باکتری های تولیدکننده آنزیم لیپاز و آنالیزهای بیوانفورماتیکی

آنزیم لیپاز (تری آسیل گلیسرول آسیل هیدرولاز EC: ۳.۱.۱.۳) در گروه هیدرولازها طبقه بندی می شود. این آنزیم حفاظت شده متعلق به خانواده استرازها می باشد؛ که موجب هیدرولیز استرها می شود و تری آسیل گلیسرول را به گلیسرول و اسیدهای چرب هیدرولیز می کند. آنزیم لیپاز یکی از پرکاربردترین آنزیم ها در صنایع مختلف ازجمله صنایع شوینده، داروسازی، آرایشی، غذایی و کاغذ می باشد. به دلیل مشکلات فرایندهای صنعتی، انجام تحقیقات در زمینه یافتن باکتری های تولیدکننده آنزیم های دارای فعالیت بهینه در دامنه های مختلف دمایی و pH و غلظت های نمکی متفاوت حائز اهمیت می باشد. در این تحقیق نمونه هایی از منطقه چشمه آب گرم سیرچ جمع آوری شد. در ادامه جهت شناسایی گونه جداسازی شده از روش توالی یابی ژن ۱۶srRNA استفاده شد. در مرحله بعد به منظور شناسایی گونه موردنظر از پایگاه اطلاعاتی BLASTn استفاده شد. در ادامه با توجه به بلاست انجام شده، نزدیک ترین توالی ژنی آنزیم لیپاز از سایت NCBI انتخاب شد و ادامه مطالعات بیوانفورماتیکی بر روی آن انجام شد. جهت بررسی ساختارهای دوم و سوم آنزیم لیپاز از پایگاه اطلاعاتی PSIPRED استفاده شد. از سرور BIBI جهت رسم درخت فیلوژنیک و از پایگاه اطلاعاتی PROTPARAM جهت بررسی درصد آمینواسیدهای حاضر در توالی استفاده شد. در این مطالعه همچنین از پایگاه های اطلاعاتی SOPMA, TMHMM, I-TASSER و CLUSTALW جهت آنالیزهای بیوانفورماتیکی آنزیم لیپاز استفاده شده است.

Keywords:

آنزیم لیپاز , ژن ۱۶srRNA , درخت فیلوژنیک , BIBI Database , آنالیز بیوانفورماتیک