ردیابی و تعیین خصوصیات مولکولی ژن پروتئین پوششی سه جدایه ایرانی ویروس آبله آلو (Plum pox virus)

ویروس آبله آلو (Plum pox virus, PPV) یکی از خسارتزاترین ویروس های درختان میوه هسته دار در دنیا می باشد. به منظور ردیابی و بررسی خصوصیات مولکولی جدایه های ایرانی PPV، طی سال های زراعی ۹۳-۹۱، تعداد ۱۳۰ نمونه برگی درختان هسته دار با علایم ویروسی از باغات درختان هسته دار استان های اردبیل ، مازندران و تهران جمع آوری شدند. ردیابی ویروس با روش های ELISA DAS-، ایمونوبلات و همچنین RT-PCR با آغازگر های اختصاصی ژن پروتئین پوششی (CP) ویروس صورت پذیرفت. نتایج بدست آمده حاکی از وجود آلودگی در برخی از نمونه ها شامل ۳ نمونه از دشت مغان، ۲۴ نمونه از جویبار و ۲ نمونه از درکه بود. محصول RT-PCR بدست آمده از تکثیر ناحیه ژن CP ویروس به طول ۹۹۰ جفت باز مربوط به سه جدایه تعیین توالی گردیده و ترادف ناحیه کد کننده با سایر جدایه های موجود در NCBI مقایسه شدند. نتایج این آزمون نشان داد که دو جدایه ۱۰s و ۱۵s (از منطقه جویبار) دارای ۹۹/۳ و ۹۹/۴ درصد تشابه با سویه M (رس شمار EF۶۲۶۵۳۳.۱) و جدایه M۶ (از دشت مغان) دارای ۹۹/۴ درصد شباهت با سویه D ویروس (رس شمار HF۵۸۵۰۹۸.۱) می باشند. این اولین گزارش از ردیابی مولکولی سویه های M و D ویروس آبله آلو بر مبنای توالی نوکلئوتیدی در مناطق ذکر شده می باشد.

Keywords:

DAS-ELISA , M and D strains , Plum Pox Virus , RT-PCR , Sequencing