بررسی رابطه بین گونه های پلاخور (Lonicera spp.) موجود در ایران با استفاده از رمزینه کردن DNA و شاخص های ریخت شناسانه
Publish place: Flower and Ornamental Plants، Vol: 7، Issue: 1
Publish Year: 1400
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 248
This Paper With 15 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_FLOWER-7-1_002
تاریخ نمایه سازی: 11 مهر 1401
Abstract:
جنس Lonicera از تیره Caprifoliaceae است و در زبان فارسی به نام های پلاخور، شونگ و یا پیچ امین الدوله (Honeysuckle) خوانده می شود. شناخت روابط بین گونه ای بر اساس ویژگی های ریخت شناسانه و بیوشیمیایی گاهی نتایج متناقضی داشته اند. در این مطالعه، برای شناسایی، جداسازی و تعیین روابط تبارزایی ۱۲ گونه Lonicera موجود درایران، از نشانگرهای ریخت شناسانه، رمزینه های DNA هسته ای و کلروپلاستی (شامل ITS و matK) همراه با چند توالی دیگر از پایگاه بانک ژن NCBI استفاده گردید. DNA ژنومی با استفاده از کیت های موجود استخراج و واکنش PCR برای تکثیر دو ناحیه مورد نظر انجام شد و در پایان نمونه های خالص سازی شده توالی یابی شدند. تجزیه خوشه ای بر اساس ویژگی های ریخت شناسانه ، گونه ها را در دو گروه بزرگ قرار داد که گروه اول شامل L. sempervirens و گروه دوم شامل ۱۱ گونه دیگر بود. نزدیکترین رابطه ژنتیکی بین گونه های L. floribunda و L. nummulariifolia و کمترین شباهت بین گونه های L. sempervirens و L. caprifolium وجود داشت. واکاوی به عامل های اصلی (Principle component analysis (PCAs)) روی داده های مربوط به ریخت شناسی نشان داد که سه عامل اول در مجموع۱/۷۱ % گوناگونی را شامل می شدند که عامل اول شامل پوشش کرکی ساقه، شکل پهنک، حاشیه برگ، شکل نوک پهنک، رنگ گل، پوشش کرکی برگ، پایین برگ و رنگ میوه، طول دمبرگ و فاصله میانگره به عنوان اجزاء اصلی، ۸/۳۸% گوناگونی را توجیه نمود. بر اساس بررسی های مولکولی، طول منطقه matK در حدود ۱۱۳۵-۱۱۱۰ نوکلئوتید بود. آنالیز پارسیمونی این ناحیه ۹۴۴ جایگاه حفاظت شده، ۱۰۹ جایگاه متغیر و ۱۹ جایگاه پارسیمون را نشان داد. در درخت تبارزایی ایجاد شده بوسیله ی ناحیه matK جداسازی همه ی گونه ها به جز دو گونه L. korolkovii و L. maackii به خوبی صورت گرفته و در شاخه های جداگانه قرار گرفتند. گوناگونی و فاصله ژنتیکی بین گونه ها در ناحیه matK با فاصله ژنتیکی ۰۰/۰ تا ۰۵۷/۰ مشاهده شد. این مطالعه نتوانست از آغازگرهای ITS جواب مطلوبی حاصل نماید. بنابراین، ناحیه matK با توجه به گوناگونی و تکثیر آسان، رمزینه مناسبی برای بررسی گوناگونی ژنتیکی بین گونه های پلاخور است.
Keywords:
Morphological marker , Barcode regions , Molecular phylogeny , Lonicera , matK , نشانگرهای ریخت شناسانه , نواحی بارکد , فیلوژنی , امین الدوله , matK
Authors
نجمه فتاحی دهکردی
Shahrekord University
مسعود قاسمی قهساره
Shahrekord University
بهروز شیران
Shahrekord University
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :