تعیین ژن های خانه دار مناسب برای مطالعه تغییر بیان ژن ها به روش Real- Time PCR در گیاه حرا (Avicennia marina) تحت تیمار نفتی

بابک مرادی; حسن زارع مایوان; منا صراحی نوبر; مهری سیدهشترودی

تعیین ژن های خانه دار مناسب برای مطالعه تغییر بیان ژن ها به روش Real- Time PCR در گیاه حرا (Avicennia marina) تحت تیمار نفتی

Publish place: Marine science and technology، Vol: 17، Issue: 4

Publish Year: 1397

Type: Journal paper

Language: Persian

This Paper With 12 Page And PDF Format Ready To Download

DOWNLOAD Paper

Certificate
I'm the author of the paper

Export:

Link to this Paper:

https://civilica.com/doc/1586962

Document National Code:

JR_JMST-17-4_006

Index date: 15 January 2023

تعیین ژن های خانه دار مناسب برای مطالعه تغییر بیان ژن ها به روش Real- Time PCR در گیاه حرا (Avicennia marina) تحت تیمار نفتی abstract

مطالعه بیان ژن ها می تواند اطلاعات مهمی از سازوکار ها و راهبردهای فیزیولوژیکی که توسط گیاهان در شرایط تنشی رخ می دهد را روشن نماید. انتخاب ژن های کنترل داخلی مناسب برای تعیین سطوح بیان ژن ها بسیار مهم و ضروری است. تاکنون برای گیاه مانگرو Avicennia marina مطالعه ای در ارتباط با معرفی ژن های مرجع مناسب برای نرمال سازی داده های RT-qPCR گزارش نشده است. در این مطالعه پایداری بیان چهار ژن مرجع اکتین ۲ (ACT۲)، زیرواحد A۳ سرین/ترئونین فسفاتاز ۲A(PP۲AA۳)، TIP-Like، پلی یوبی کوئیتین ۱۰ (UBQ)، در برگ و ریشه گیاه حرا در غلظت های مختف نفت مورد بررسی قرار گرفت. سه نرم افزار (Best Keeper، NormFinder و gNorm) برای آنالیز رتبه بندی ژن ها مورد استفاده قرار گرفت. نتایج نشان داد که ژن ACT یک ژن مرجع مناسب برای گیاه حرا تحت تیمار نفتی است اما استفاده از دو یا سه ژن برای دست یافتن به دقت بالاتر پیشنهاد شد. شناسایی ژن های مرجع در نمونه های بیشتر و تحت شرایط تنشی متنوع تر در آزمایش های آتی به ویژه در تنش های مشابه پیشنهاد شده است.

تعیین ژن های خانه دار مناسب برای مطالعه تغییر بیان ژن ها به روش Real- Time PCR در گیاه حرا (Avicennia marina) تحت تیمار نفتی Keywords:

مانگروها , Avicennia marina , ژن های مرجع , نرمال سازی , آلودگی نفتی

تعیین ژن های خانه دار مناسب برای مطالعه تغییر بیان ژن ها به روش Real- Time PCR در گیاه حرا (Avicennia marina) تحت تیمار نفتی authors

بابک مرادی

گروه علوم گیاهی، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران

حسن زارع مایوان

گروه علوم گیاهی، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران

منا صراحی نوبر

گروه علوم گیاهی، دانشکده زیست شناسی، پردیس علوم، دانشگاه تهران، تهران، ایران

مهری سیدهشترودی

گروه علوم زیستی دریا، پژوهشکده علوم دریایی، پژوهشگاه ملی اقیانوس شناسی و علوم جوی، تهران، ایران

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :

Czechowski, T., Stitt, M., Altmann, T., Udvardi, M.K. and Scheible, ...

Die, J.V., Román, B., Nadal, S. and González-Verdejo, C.I. ۲۰۱۰. ...

Ebrahimi-Sirizi, Z. and Riyahi-Bakhtiyari, A. ۲۰۱۳. Petroleum pollution in mangrove ...

Heid, C.A., Stevens, J., Livak, K.J. and Williams, P.M. ۱۹۹۶. ...

Higuchi, R., Fockler, C., Dollinger, G. and Watson, R. ۱۹۹۳. ...

Hong, S.M., Bahn, S.C., Lyu, A., Jung, H.S. and Ahn, ...

Hu, R., Fan, C., Li, H., Zhang, Q. and Fu, ...

Kong, Q., Yuan, J., Gao, L., Zhao, S., Jiang, W., ...

Kong, Q., Yuan, J., Niu, P., Xie, J., Jiang, W., ...

Kozera, B. and Rapacz, M. ۲۰۱۳. Reference genes in real-time ...

Kulcheski, F.R., Marcelino-Guimaraes, F.C., Nepomuceno, A.L., Abdelnoor, R.V. and Margis, ...

Li, X.-S., Yang, H.-L., Zhang, D.-Y., Zhang, Y.-M. and Wood, ...

Lilly, S., Drummond, R., Pearson, M. and MacDiarmid, R. ۲۰۱۱. ...

Løvdal, T. and Lillo, C. ۲۰۰۹. Reference gene selection for ...

Peng, Y.-L., Wang, Y.-S. and Gu, J.-D. ۲۰۱۵. Identification of ...

Ramakers, C., Ruijter, J.M., Deprez, R.H.L. and Moorman, A.F. ۲۰۰۳. ...

Rashvand, S. and Sadeghi, S.M. ۲۰۱۴. Distribution, Characteristics and Economic ...

Remans, T., Smeets, K., Opdenakker, K., Mathijsen, D., Vangronsveld, J. ...

Ruijter, J., Ramakers, C., Hoogaars, W., Karlen, Y., Bakker, O., ...

Schena, M., Shalon, D., Davis, R.W. and Brown, P.O. ۱۹۹۵. ...

Shivhare, R., Lata, C. ۲۰۱۶. Selection of suitable reference genes ...

Thellin, O., Zorzi, W., Lakaye, B., De Borman, B., Coumans, ...

Tian, C., Jiang, Q., Wang, F., Wang, G.-L., Xu, Z.-S. ...

van Bochove, J., Sullivan, E. and Nakamura, T. ۲۰۱۴. The ...

Wang, H., Wang, J., Jiang, J., Chen, S., Guan, Z., ...

Wang, X., Liu, Y. and Yang, P. ۲۰۱۲. Proteomic studies ...

Yang, Y., Hou, S., Cui, G., Chen, S., Wei, J. ...

نمایش کامل مراجع