شناسایی اختصاصی نماتد ریشه ‎گرهی Meloidogyne incognita رایج در باغات کیوی فروت استان های گیلان و مازندران با استفاده از توالی ژن sec-۱

در سال­های اخیر، شیوع بیش از پیش نماتدهای ریشه‎ گرهی باعث ایجاد خسارت جدی در مناطق کشت کیوی فروت در شمال ایران شده است. با توجه به رواج چند گونه از این جنس در کشور، شناسایی دقیق گونه­های این نماتد در صنعت تولید محصول حائز اهمیت است. در این تحقیق، تلاش شد شناسایی مولکولی نماتد ریشه‎ گرهی به کمک واکنش زنجیره ای پلی­مراز، با استفاده از آغازگرهای اختصاصی ژن کدکننده یکی از پروتئین­های غدد مری (pharyngeal gland secretory protein, sec-۱) در جهت تایید شناسایی­های مبتنی بر ویژگی های ریخت­­ شناختی صورت گیرد. بدین منظور، پس از انجام نمونه برداری و جداسازی نماتدها از باغ های کیوی فروت آلوده در استان های گیلان و مازندران، اقدام به شناسایی اولیه با استفاده از خصوصیات ریخت ­شناختی گردید. جفت آغازگرهای Inc-K۱۴ برای تکثیر ناحیه SCAR و جفت آغازگرهای SEC-۱ برای تکثیر ژن sec-۱ به منظور تشخیص اختصاصی گونه Meloidogyne incognita از سایر گونه ها مورد استفاده قرار گرفتند. در همه نمونه های مورد بررسی، قطعه ای ۳۹۹ جفت بازی توسط جفت آغازگرهای Inc-K۱۴ و قطعه ای ۵۰۲ جفت بازی توسط جفت آغازگرهای SEC-۱ تکثیر گردید که قطعات مورد انتظار برای شناسایی گونه M. incognita می باشند. انجام آزمون PCR با استفاده از آغازگرهای Rjav/Fjav، Rar/Far و Rh/Fh که به ترتیب آغازگرهای اختصاصی گونه­های M. javanica، M. arenaria و M. hapla هستند، در این مطالعه منجر به تکثیر باند نشد. با توجه به نتایج به دست آمده، آغازگر SEC-۱ جهت شناسایی سریع و دقیق M. incognita در باغ های آلوده کیوی فروت (در این مطالعه) مناسب بوده و مشکلات تکثیر غیراختصاصی با آغازگرهای Inc-K۱۴ که ناحیه SCAR را تکثیر می­ کنند، نخواهد داشت.

شناسایی اختصاصی نماتد ریشه ‎گرهی Meloidogyne incognita رایج در باغات کیوی فروت استان های گیلان و مازندران با استفاده از توالی ژن sec-۱ Keywords:

آغازگر SEC-۱ , شناسایی مولکولی , ناحیه SCAR