تنوع ژنتیکی و بیماریزایی جدایه های Xanthomonas translucens عامل لکه نواری باکتریایی گندم در استان های خراسان

Publish Year: 1402
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 129

This Paper With 20 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

JR_JOAGK-15-2_006

تاریخ نمایه سازی: 27 خرداد 1402

Abstract:

هدف: لکه نواری باکتریایی گندم یکی از مهمترین بیماری­های باکتریایی گندم در سراسر جهان است. گونه Xanthomonas translucens  سبب بروز این بیماری می­شود. بررسی بیماریزایی جدایه­های به دست آمده از لکه نواری باکتریایی بر روی بوته­های گندم، بررسی مقاومت ارقام مختلف گندم در برابر جدایه با بالاترین قدرت بیماریزایی، شناسایی مولکولی جدایه­ها و بررسی تنوع ژنتیکی جدایه­ها از اهداف این تحقیق  به شمار می­رود. مواد و روش ها: نمونه­برداری از مزارع گندم آلوده به این بیماری در سه استان خراسان رضوی، خراسان شمالی و لرستان انجام شد. قسمت­های دارای علائم پس از ضد عفونی سطحی و ایجاد سوسپانسیون در آب مقطر استریل، روی محیط آگار غذایی حاوی سوکروز کشت  شدند. آزمون بیماریزایی تمام جدایه­ها روی بوته­های گندم رقم فلات بررسی شد. مقاومت ارقام مختلف گندم در برابر جدایه نماینده مورد بررسی قرار گرفت. آزمون rep-PCR با استفاده از آغازگرهای ERIC و BOX برای ارزیابی تنوع ژنتیکی جدایه­ها استفاده شد. برای شناسایی جدایه­های نماینده، بخشی از ژن­های gyrB  و dnaK  جدایه­ها تکثیر و توالی­یابی شدند. نتایج: کلونی­های باکتریایی با مشخصات زرد روشن، گرد و صاف جداسازی و خالص گردید. آزمون بیماریزایی تمام جدایه­ها روی بوته­های گندم اثبات گردید. جدایه­ها در میزان بیماریزایی روی گندم متفاوت بودند. جدایه با بالاترین میزان بیماریزایی، به ارقام مختلف گندم تلقیح شد. پاسخ ارقام مختلف گندم به جدایه منتخب متفاوت بود اما در نهایت همگی به این جدایه حساس بودند. آنالیز خوشه­ای الگوی باندی به دست آمده با آغازگرهای ERIC و BOX با استفاده از برنامه NTSYS انجام گردید. نتایج بررسی­های مولکولی با تکنیک­ انگشت نگاری DNA نشان داد که تنوع ژنتیکی بین جدایه­های لکه نواری باکتریایی به دست آمده از مناطق مختلف کشت گندم مورد مطالعه وجود دارد. در دندروگرام ترکیبی رسم شده حاصل از دو نشانگر، جدایه­ها در سطح تشابه ۳۳% به پنج گروه تقسیم شدند. مقایسه توالی نوکلئوتیدی جدایه­های نماینده با توالی­های مشابه در ژن بانک، نشان دهنده تشابه بالای توالی­های مورد بررسی ­با توالی­های Xanthomonas translucens pv. undulosa موجود در ژن بانک NCBI بود. نتیجه گیری: استفاده از آزمون rep-PCR برای بررسی تنوع ژنتیکی جدایه­های به دست آمده مناسب می­باشند. در این مطالعه موقیعت جغرافیایی اثری بر روی گروه­بندی جدایه­ها نداشت. بیماری نواری باکتریایی تقریبا در تمام مناطق کشت گندم یافت می­شود و درک بهتر برهمکنش گیاه- بیمارگر در Xanthomonas translucens-گندم برای یافتن و توسعه ارقام مقاوم به این بیماری ضروری به نظر می­رسد.

Authors

مجتبی دهقان نیری

دانشجوی دکتری، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد، ایران

سعید طریقی

دانشیار، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد، ایران

پریسا طاهری

استاد، گروه گیاهپزشکی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه فردوسی مشهد، مشهد، ایران

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • عربی فرشته، نیکروش زهرا، بابایی زاد ولی اله و همکاران ...
  • عسکری ناهید، باقی زاده امین، محمدآبادی محمدرضا (۱۳۸۹). مطالعه تنوع ...
  • محمدی فر آمنه، فقیه ایمانی سید علی، محمدآبادی محمد رضا، ...
  • محمدی فر آمنه، محمدآبادی محمد رضا (۱۳۹۰) کاربرد نشانگرهای ریزماهواره ...
  • ReferencesAdhikari TB, Hansen, JM, Gurung S, Bonman JM (۲۰۱۱) Identification ...
  • Adhikari TB, Gurung S, Hansen JM, Bonman JM (۲۰۱۲) Pathogenic and ...
  • Alizadeh A, Rahimian H (۱۹۸۹) Bacterial Leaf Streak of Gramineae ...
  • Arabi F, Nickravesh Z, Babaizad V et al. )۲۰۰۶( The ...
  • Askari N, Baghizadeh A, Mohammadabadi MR (۲۰۱۰) Study of genetic ...
  • Askari N, Baghizadeh A, Mohammadabadi MR (۲۰۰۸) Analysis Of The ...
  • Bragard C, Singer E, Alizadeh A et al. (۱۹۹۷) Xanthomonas ...
  • Clavijo F, Curland RD, Croce V et al (۲۰۲۲) Genetic ...
  • Curland RD, Gao L, Bull CT et al. (۲۰۱۸) Genetic ...
  • Duveiller E, Fucikovsky L, Rudolph K (۱۹۹۷) The bacterial diseases ...
  • Falahi Charkhabi N, Shams-bakhsh M, Rahimian H (۲۰۱۵) Reaction of ...
  • Figueroa M, Hammond-kosack KE, Solomon PS (۲۰۱۸) A review of ...
  • Ghasemi M, Baghizadeh A, Abadi MRM (۲۰۱۰) Determination of genetic ...
  • Gholamhoseinzadeh Gooki F, Mohammadabadi MR, Asadi Fozi M (۲۰۱۸) Polymorphism ...
  • Gholamhoseinzadeh Gooki F, Mohammadabadi M, Fozi MA, Soflaei M (۲۰۱۹) ...
  • Ji GH, Wei LF, He YQ et al (۲۰۰۸). Biological ...
  • Katkar M, Raghuwanshi KS, Chimote VP, Borkar SG (۲۰۱۶) Pathological, ...
  • Khojasteh M, Taghavi SM, Khodaygan P et al. (۲۰۱۹) Molecular ...
  • Kölliker R, Kraehenbuehl R, Boller B, Widmer F (۲۰۰۶) Genetic ...
  • Langlois PA, Snelling J, Hamilton JP et al. (۲۰۱۷) Characterization ...
  • Louws FJ, Fulbright DW, Stephens CT, de Bruijn FJ (۱۹۹۴) ...
  • Manigundan K, Puneeth Kumar P, Singh R et al. (۲۰۱۷) ...
  • Milus EA, Mirloh AF (۱۹۹۴) Use of Disease Reactions to ...
  • Milus EA, Chalkly DB (۱۹۹۴) Virulence of Xanthomonas campestris pv. ...
  • Mohammadabadi MR (۲۰۱۷) Inter-Simple Sequence Repeat loci Associations with Predicted ...
  • Mohammadabadi MR, Esfandyarpoor E, Mousapour A (۲۰۱۷) Using Inter Simple ...
  • Mohammadifar A, Faghih Imani SA, Mohammadabadi MR, Soflaei M (۲۰۱۴) ...
  • Mohammadifar A, Mohammadabadi MR (۲۰۱۸) Melanocortin-۳ receptor (MC۳R) gene association ...
  • Mohammadifar A, Mohammadabadi MR (۲۰۱۱) Application of Microsatellite Markers for ...
  • Popovic T, Balaž J, Ignjatov M et al. (۲۰۱۴) Identification ...
  • Rademaker JLW, Norman DJ, Forster RL et al. (۲۰۰۶) Classification and ...
  • Rezene Y, Mitiku M, Tesfaye K et al. (۲۰۱۸) Analysis ...
  • Rohlf FJ (۲۰۰۰). NTSYSpc: Numerical Taxonomy System, ver. ۲.۱. Exeter ...
  • Saeedi Madani A, Marefat A, Behboudi K, Ghasemi A (۲۰۱۰) ...
  • Sapkota S, Megoum M, Liu Z (۲۰۲۰) The translucens group ...
  • Schaad NW, Jones JB, Chun W (۲۰۰۱) Laboratory Guide for ...
  • Smith EF, Jones LR, Reddy CS (۱۹۱۹) The Black Chaff of ...
  • Tamura K, Stecher G, Peterson D et al. (۲۰۱۳) MEGA۶: ...
  • Thanh TL, Thumanu K, Wongkaew S et al. (۲۰۱۷) Salicylic ...
  • Vancheva, T., Stoyanova, M., Tasheva-Terzieva, E et al. (۲۰۱۸) Molecular ...
  • Versalovic J, Koeuth T, Lupski JR (۱۹۹۱) Distribution of repeti­tive ...
  • Versalovic J, Schneider M, de Bruijn FJ, Lupski JR (۱۹۹۴) ...
  • Xu J, Audenaert K, Hofte M, De Vleesschauwer A (۲۰۱۳) ...
  • Young JM, Park DC, Shearman HM, Fargier E (۲۰۰۸) A ...
  • نمایش کامل مراجع