ارزیابی تنوع ژنتیکی گوجه فرنگی (Solanum lycopersicum L.) مبتنی بر مقایسه کارآیی دو نشانگر SSR و ISSR
Publish place: Journal of agricultural biotechnology، Vol: 15، Issue: 2
Publish Year: 1402
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 90
This Paper With 20 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_JOAGK-15-2_004
تاریخ نمایه سازی: 27 خرداد 1402
Abstract:
هدف: این تحقیق بهمنظور ارزیابی تنوع ژنتیکی تودههای گوجه فرنگی متعلق به کلکسیون هسته بانک ژن گیاهی ملی ایران انجام شد. همچنین بررسی مقایسهای کارآیی دو نشانگر مولکولی SSR و ISSR در بررسی تنوع ژنتیکی و قابلیت تفکیک تودههای مختلف گوجه فرنگی از اهداف دیگر این مطالعه بود. مواد و روش ها: در این تحقیق تنوع ژنتیکی بین و درون گونهای ۳۰ توده گوجه فرنگی متعلق به تواحی مختلف ایران و جهان ارزیابی شد. برای این منظور نمونههای برگی مورد نیاز در مرحله چهار برگی از تودههای مورد بررسی برداشت و پس از استخراج DNA انگشت نگاری با استفاده از ۱۳ نشانگر ISSR و ۵ نشانگر SSR انجام شد. نتایج: تعداد قطعات تکثیر شده چند شکل و متوسط شاخصهای قدرت تفکیک و شاخص نشانگری برای نشانگر ISSR بیشتر از SSR بود. با این حال محتوای اطلاعات چندشکلی در نشانگر SSR بیشتر از ISSR بهدست آمد. نتایج حاصل از تجزیه واریانس مولکولی نشان داد که هر دو سیستم نشانگری کارآیی مطلوبی در ارزیابی تنوع بین گونهای داشتند، بهطوریکه بیشترین تنوع ژنتیکی مشاهده شده در بین گونه بیشتر از درون گونه برآورد شد. در برآورد پارامترهای ژنتیکی نیز نشانگر SSR در کلیه پارامترها مقادیر بزرگتری را در مقایسه با نشانگر ISSR داشت. همچنین این مقادیر در S. lycopersicum esculantum بیشتر ازS. lycopersicum cherry بود. در تجزیه خوشهای بر اساس هر کدام از نشانگرهای مورد استفاده، تودههای گوجه فرنگی مورد بررسی در ۴ گروه قرار گرفتند. از تجزیه به مختصات اصلی بهمنظور ارزیابی دقیقتر گروههای حاصل از تجزیه خوشهای استفاده و مشخص شد که آغازگرهای SSR از کارآیی ملموستری در بیان تنوع ژنتیکی موجود در بین تودههای ایرانی و S. lycopersicum Cherry برخوردار بودند، در حالی که آغازگرهای ISSR تودههای متعلق به S. lycopersicum esculantum را بهتر متمایز نمودند. نتیجهگیری: نتایج این تحقیق حاکی از وجود تنوع ژنتیکی بالا در درون و بین گونههای گوجه فرنگی مورد مطالعه بود. با توجه به خصوصیات مشاهده شده در هر کدام از نشانگرهای مورد استفاده میتوان انتظار داشت که کاربرد آغازگرهای ISSR برای اشباع نقشههای ژنتیکی و آغازگرهای SSR در بررسی ساختار جمعیت و گروهبندی تودههای مختلف از کارآیی بالاتری برخوردار باشد.
Keywords:
Authors
فاطمه حسینی
دانشجوی کارشناسی ارشد ژنتیک، گروه علوم سلولی و مولکولی، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه خوارزمی، تهران، ایران
آزاده نیک نژاد
استادیار بیوتکنولوژی، گروه علوم سلولی و مولکولی، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه خوارزمی، تهران، ایران
بهزاد سرخی لله لو
موسسه تحقیقات اصلاح و تهیه نهال و بذر
جهانگیر عباسی کوهپالکانی
استادیار، موسسه تحقیقات اصلاح و تهیه نهال و بذر، سازمان تحقیقات آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران
مانی معرفت زاده خامنه
محقق، موسسه تحقیقات اصلاح و تهیه نهال و بذر، سازمان تحقیقات آموزش و ترویج کشاورزی، کرج، ایران
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :