پویش ژنومی نشانه های انتخاب در گوسفندان پوستی و پشمی ایرانی با استفاده از روش های برآوردگر نااریب FST و hapFLK
Publish place: Animal Production Research، Vol: 12، Issue: 2
Publish Year: 1402
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 112
This Paper With 19 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_ARGU-12-2_007
تاریخ نمایه سازی: 26 آبان 1402
Abstract:
بررسی نشانههای انتخاب در کل ژنوم به شناسایی ساز و کارهای انتخاب و تشخیص مناطقی از ژنوم که طی سالیان متمادی بهصورت طبیعی و یا مصنوعی انتخاب شدهاند، کمک میکند. هدف از این پژوهش، شناسایی نقاطی از ژنوم در گوسفندان پوستی و پشمی بود که طی سالهای مختلف انتخاب شدهاند. بدین منظور، ۸۰ راس گوسفند پوستی (قرهگل، سیاهکبود و کبودهشیراز) و پشمی (سنجابی، کرمانی و بلوچی) با استفاده از آرایههای گوسفندیk ۶۰۰ تعیین ژنوتیپ شدند. برای شناسایی نشانههای انتخاب از آزمون نااریبFST (تتا) و آزمون hapFLK استفاده شد .نتایج تتا، ۲۶ منطقه ژنومی روی کروموزومهای ۱، ۲، ۶، ۱۹ و ۲۴، و نتایج hapFLK، هفت منطقه ژنومی روی کروموزومهای ۶ و ۱۹ شناسایی کرد. تجزیه و تحلیل اطلاعات زیستی (بیوانفورماتیکی) نشان داد که برخی از این مناطق ژنومی با ژنهای موثر بر صفات رنگدانه و مشخصات پشم (KIT، MITF، IGSF۱۰ و PDGFRA)، عضلات (MICALL۲)، اتساع عروق و پاسخ ایمنی (P۲RY) و سرطان (MIR۳۳۹، ELFN۱، MAD۱L۱ و GPR۸۷) همپوشانی دارند. بررسی QTLهای گزارش شده نیز نشان داد که این مناطق با QTLهای صفات مهم اقتصادی از جمله صفات مرتبط با مشخصات گوشت، لاشه، شیر، وزن بدن، تراکم استخوان و تعداد کل برههای متولد شده در ارتباط هستند. همچنین نواحی مورد انتخاب با مسیرهای درگیر در تمایز ملانوسیت و رنگدانهها، تمایز سلولهای بنیادی، فرآیندهای سلولی، توسعه سیستم ایمنی، سیستم خونی، فرآیندهای باروری و سلولی ارتباط داشتند. به هر حال، برای شناسایی نقش دقیق ژنها و QTLهای شناسایی شده، لازم است مطالعات تکمیلی انجام گیرد.
Keywords:
Authors
زهرا پتی آبادی
دانشجوی دکتری، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه کردستان
محمد رزم کبیر
دانشیار، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه کردستان
علی اسمعیلی زاده کشکوئیه
استاد، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه شهید باهنر کرمان
محمدحسین مرادی
دانشیار، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه اراک
امیر رشیدی
استاد، گروه علوم دامی، دانشکده کشاورزی، دانشگاه کردستان
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :