سیویلیکا را در شبکه های اجتماعی دنبال نمایید.

Login
PapersConferencesJournals

تعیین توالی و بررسی فیلوژنی ژن هم سان APETALA ۱ در شاهی

Publish place: Nova Biologica Reperta، Vol: 5، Issue: 4
Publish Year: 1397
Type: Journal paper
Language: Persian
View: 152

This Paper With 9 Page And PDF Format Ready To Download

DOWNLOAD Paper

Export:

Link to this Paper:
https://civilica.com/doc/1834947

Document National Code:

JR_NBR-5-4_008

Index date: 29 November 2023

تعیین توالی و بررسی فیلوژنی ژن هم سان APETALA ۱ در شاهی abstract

پیش روی فرایند گل دهی در گیاهان، از طریق تحریک مریستم گل آذین به وسیله ی چندین مسیر آغاز می شود. بسیاری از ژن های دخیل در این مسیرها فاکتورهای رونویسی خانواده دومین MADS را کد می کنند. فاکتور رونویسی APETALA۱ (AP۱)، یکی از تنظیم کننده های کلیدی نمو گل، از این خانواده است. اولین قدم برای فهم مکانیسم های مولکولی تحت عمل کرد هر ژن در یک گیاه، شناسایی، تعیین توالی و سپس بررسی فیلوژنی ژن مورد نظر است. بدین منظور، RNA کل از غنچه گل شاهی (Lepidium sativum L.) استخراج و برای ساخت cDNA استفاده گردید. آغازگر های اختصاصی بر اساس توالی ژن های همسان AP۱ در گیاهان هم خانواده، طراحی و برای واکنش RT-PCR مورد استفاده قرار گرفت. پس از بررسی الگوی مناسب الکتروفورزی آن و حصول اطمینان از کیفیت محصول PCR بدست آمده، قطعه ی تکثیر شده برای توالی یابی فرستاده شد. نتیجه توالی یابی پس از دریافت، با نرم افزارهای BLAST، MUSCLE، Gene Runner و MEGA۶ مورد بررسی قرار گرفت. نتایج، نشان دهنده تکثیر طول کامل ناحیه ی کدشونده ژن به تعداد ۷۸۷ نوکلئوتید بود که LsAP۱ نامیده شد و با شماره دست رسی KP۰۷۰۷۲۸ در پایگاه NCBI ثبت گردید. بررسی ها بیانگر تشابه بالا و همچنین هم پوشانی زیاد توالی های موجود در بانک ژن با توالی پروتئین استنباطی LsAP۱، بود. مطابق با این نتایج، LsAP۱ نیز به احتمال به عنوان هومولوگ ژن AP۱ در گذر به گل دهی نقش دارد و می تواند به عنوان ژن تعیین هویت مریستم گل عمل کند.

تعیین توالی و بررسی فیلوژنی ژن هم سان APETALA ۱ در شاهی Keywords:

تعیین توالی و بررسی فیلوژنی ژن هم سان APETALA ۱ در شاهی authors

Mahboubeh Sheikhbahaei

Shahid Bahonar University of Kerman

Farkhondeh Rezanejad

Shahid Bahonar University of Kerman

Hossein-Ali Sasan

دانشگاه شهید باهنر کرمان

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
Aikawa, S., Kobayashi, M.J., Satake, A., Shimizu, K.K. and Kudoh, ...
Burko, Y., Shleizer-Burko S., Yanai, O., Shwartz, I., Zelnik, I.D., ...
Dieffenbach, C., Lowe, T. and Dveksler, G. ۱۹۹۳. General concepts ...
Favaro, R., Pinyopich, A., Battaglia, R., Kooiker, M., Borghi, L., ...
Grandi, V., Gregis, V. and Kater, M.M. ۲۰۱۲. Uncovering genetic ...
Guo, H., Yang, H., Mockler, T.C. and Lin, C. ۱۹۹۸. ...
Honma, T. and Goto, K. ۲۰۰۱. Complexes of MADS-box proteins ...
Irish, V.F. and Sussex, I.M. ۱۹۹۰. Function of the apetala-۱ ...
Jack, T. ۲۰۰۴. Molecular and genetic mechanisms of floral control. ...
Jack, T., Brockman, L.L. and Meyerowitz, E.M. ۱۹۹۲. The homeotic ...
Kasabe, P.J., Patil, P.N., Kamble, D.D. and Dandge, P.B. ۲۰۱۲. ...
Kong, D., Shen, X., Guo, B., Dong, J., Li, Y. ...
Liljegren, S.J., Gustafson-Brown, C., Pinyopich, A., Ditta, G.S. and Yanofsky, ...
Liu, C., Xi, W., Shen, L., Tan, C. and Yu, ...
Lü, J., Wu, Y., Sun, L. and Zhang, Q. ۲۰۰۷. ...
Mandel, M.A., Gustafson-Brown, C., Savidge, B. and Yanofsky, M.F.J.N. ۱۹۹۲ ...
Mandel, M.A., and Yanofsky, M.F. ۱۹۹۵. A gene triggering flower ...
Marchler-Bauer, A., Bo, Y., Han, L., He, J., Lanczycki, C.J., ...
Melzer, R., Wang, Y. and Theißen, G. ۲۰۱۰. The naked ...
Menzel, G., Apel, K. and Melzer, S. ۱۹۹۵. Isolation and ...
Mibus, H., Heckl, D. and Serek, M. ۲۰۱۱. Cloning and ...
Ng, M. and Yanofsky, M.F. ۲۰۰۱. Activation of the Arabidopsis ...
Ó'Maoiléidigh, D.S., Graciet, E. and Wellmer, F. ۲۰۱۴. Gene networks ...
Pabón-Mora, N., Ambrose, B.A. and Litt, A. ۲۰۱۲. Poppy APETALA۱/FRUITFULL ...
Pelaz, S., Gustafson‐Brown, C., Kohalmi, S.E., Crosby, W.L. and Yanofsky, ...
Pe-a, L., Martín-Trillo, M., Juárez, J., Pina, J.A., Navarro, L. ...
Riechmann, J.L., Krizek, B.A. and Meyerowitz, E.M. ۱۹۹۶. Dimerization specificity ...
Sambrook, J., Russell, D.W. and Russell, D.W. ۲۰۰۱. Molecular cloning: ...
Shore, P. and Sharrocks, A.D. ۱۹۹۵. The MADS‐box family of ...
Shukla, A., Singh, C.S. and Bigoniya, P. ۲۰۱۱. Phytochemical and ...
Suárez-López, P., Wheatley, K., Robson, F., Onouchi, H., Valverde, F. ...
Tang, M., Tao, Y.B. and Xu, Z.F. ۲۰۱۶. Ectopic expression ...
Theissen, G. and Saedler, H. ۲۰۰۱. Plant biology: floral quartets. ...
Theologis, A., Ecker, J.R., Palm, C.J., Federspiel, N.A., Kaul, S., ...
Wellmer, F. and Riechmann, J.L. ۲۰۱۰. Gene networks controlling the ...
Xu, Z., Ali, Z., Yi, J., He, X., Zhang, D., ...
Aikawa, S., Kobayashi, M.J., Satake, A., Shimizu, K.K. and Kudoh, ...
Burko, Y., Shleizer-Burko S., Yanai, O., Shwartz, I., Zelnik, I.D., ...
Dieffenbach, C., Lowe, T. and Dveksler, G. ۱۹۹۳. General concepts ...
Favaro, R., Pinyopich, A., Battaglia, R., Kooiker, M., Borghi, L., ...
Grandi, V., Gregis, V. and Kater, M.M. ۲۰۱۲. Uncovering genetic ...
Guo, H., Yang, H., Mockler, T.C. and Lin, C. ۱۹۹۸. ...
Honma, T. and Goto, K. ۲۰۰۱. Complexes of MADS-box proteins ...
Irish, V.F. and Sussex, I.M. ۱۹۹۰. Function of the apetala-۱ ...
Jack, T. ۲۰۰۴. Molecular and genetic mechanisms of floral control. ...
Jack, T., Brockman, L.L. and Meyerowitz, E.M. ۱۹۹۲. The homeotic ...
Kasabe, P.J., Patil, P.N., Kamble, D.D. and Dandge, P.B. ۲۰۱۲. ...
Kong, D., Shen, X., Guo, B., Dong, J., Li, Y. ...
Liljegren, S.J., Gustafson-Brown, C., Pinyopich, A., Ditta, G.S. and Yanofsky, ...
Liu, C., Xi, W., Shen, L., Tan, C. and Yu, ...
Lü, J., Wu, Y., Sun, L. and Zhang, Q. ۲۰۰۷. ...
Mandel, M.A., Gustafson-Brown, C., Savidge, B. and Yanofsky, M.F.J.N. ۱۹۹۲ ...
Mandel, M.A., and Yanofsky, M.F. ۱۹۹۵. A gene triggering flower ...
Marchler-Bauer, A., Bo, Y., Han, L., He, J., Lanczycki, C.J., ...
Melzer, R., Wang, Y. and Theißen, G. ۲۰۱۰. The naked ...
Menzel, G., Apel, K. and Melzer, S. ۱۹۹۵. Isolation and ...
Mibus, H., Heckl, D. and Serek, M. ۲۰۱۱. Cloning and ...
Ng, M. and Yanofsky, M.F. ۲۰۰۱. Activation of the Arabidopsis ...
Ó'Maoiléidigh, D.S., Graciet, E. and Wellmer, F. ۲۰۱۴. Gene networks ...
Pabón-Mora, N., Ambrose, B.A. and Litt, A. ۲۰۱۲. Poppy APETALA۱/FRUITFULL ...
Pelaz, S., Gustafson‐Brown, C., Kohalmi, S.E., Crosby, W.L. and Yanofsky, ...
Pe-a, L., Martín-Trillo, M., Juárez, J., Pina, J.A., Navarro, L. ...
Riechmann, J.L., Krizek, B.A. and Meyerowitz, E.M. ۱۹۹۶. Dimerization specificity ...
Sambrook, J., Russell, D.W. and Russell, D.W. ۲۰۰۱. Molecular cloning: ...
Shore, P. and Sharrocks, A.D. ۱۹۹۵. The MADS‐box family of ...
Shukla, A., Singh, C.S. and Bigoniya, P. ۲۰۱۱. Phytochemical and ...
Suárez-López, P., Wheatley, K., Robson, F., Onouchi, H., Valverde, F. ...
Tang, M., Tao, Y.B. and Xu, Z.F. ۲۰۱۶. Ectopic expression ...
Theissen, G. and Saedler, H. ۲۰۰۱. Plant biology: floral quartets. ...
Theologis, A., Ecker, J.R., Palm, C.J., Federspiel, N.A., Kaul, S., ...
Wellmer, F. and Riechmann, J.L. ۲۰۱۰. Gene networks controlling the ...
Xu, Z., Ali, Z., Yi, J., He, X., Zhang, D., ...
نمایش کامل مراجع