جداسازی برخی از باکتریهای میکروبیوم شور دریاچه ارومیه
Publish place: Nova Biologica Reperta، Vol: 9، Issue: 4
Publish Year: 1401
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 72
This Paper With 10 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_NBR-9-4_004
تاریخ نمایه سازی: 9 آذر 1402
Abstract:
دریاچه ارومیه بزرگترین دریاچه داخلی ایران و دومین دریاچه شور دنیا است. برای شناسایی باکتری های کاملا شور پسند دریاچه از طریق غربال با مارکرهای مولکولی، طی فصول مختلف سال های ۱۳۹۷ و ۱۳۹۸ از آب، لجن و خاک مناطق مختلف دریاچه نمونه هایی جمع آوری و به آزمایشگاه منتقل گردید. با استفاده از محیط های کشت عمومی جدایه های باکتریایی از نمونه ها جداسازی و برای بررسی تنوع گونه ای از نشانگر مولکولی ERIC استفاده گردید. پس از خوشه بندی ژنتیکی گونه ها، از هر خوشه یک باکتری به عنوان نماینده انتخاب و با رمزینه گذاری ناحیه ۱۶srDNA مورد شناسایی قرار گرفتند. تست های بیوشیمیایی برای تایید نتایج مولکولی انجام گردید. در مجموع، ۱۰۲ جدایه باکتری از نمونه ها جداسازی شد که فقط ۲۹ جدایه بسیار شورپسند بودند. نشانگر مولکولی ERIC نشان داد که جدایه ها می توانند به پنج گروه منتسب شوند. پنج جدایه منتخب از هر خوشه، با آغازگرهای ناحیه ۱۶SrDNA تکثیر و توالی یابی شدند که نتایج نشان داد که پنج جدایه منتخب با اطمینان ۹۹ درصد متعلق به گونه های Microbulbifer halophilus،Halomonas salina، Bacillus sonorensis،Salinivibrio costicola و Bacillus aquimaris هستند. نتایج شناسایی مولکولی با نتایج آزمونهای بیوشیمیایی مطابقت داشت.
Keywords:
ERIC-PCR , Halotolerant , Microbiome , Urmia Lake , اریک پی سی آر , دریاچه ارومیه , میکروبیوم , شورپسند
Authors
Mehri Farzadi
Plant Protection Department, Faculty of Agriculture, University of Tabriz, Tabriz, Iran
Reza Khakvar
Plant Protection Department, Faculty of Agriculture, University of Tabriz, Tabriz, Iran
Abolghasem Mohammadi
Plant Biotechnology and Breeding, Faculty of Agriculture, University of Tabriz, Tabriz, Iran
Thomas Rattai
Department of Microbiology and Ecosystem Science, Faculty of Life Sciences, University of Vienna, Vienna, Austria
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :