همراهی فیتوپلاسما Candidatus در درختان میوه هسته دار استان گلستان: گزارش یک مطالعه تشخیصی

در بازدید­های بهار، تابستان و پاییز سال­های ۱۴۰۰و ۱۴۰۱ از باغات درختان میوه هسته ­دار استان گلستان، علائم مشکوک به بیماری فیتوپلاسمایی مانند زردی، زوال، قرمز شدن و ریز­برگی مشاهده شد و ۲۸ نمونه از برگ میزبان­های مختلف درختان میوه هسته­ دار جمع آوری گردید. از آغاز­گر­های عمومی P۱/P۷ برای آزمون PCR عمومی و آغاز­گر­های R۱۶F۲n/ R۱۶R۲ برای آزمون PCR آشیانه ای استفاده شد. نمونه های آلوده قطعات ۱۸۰۰ جفت باز را در PCR عمومی و قطعه ۱۲۵۰ جفت باز را در PCR آشیانه ای تکثیر کردند که از بین ۲۸ نمونه جمع ­آوری شده، ۳ نمونه از درختان هلو دارای باند در ناحیه مد­نظر بودند؛ سپس محصول PCR آشیانه ای پس از توالی­ یابی در بانک جهانی ژن با شماره دسترسی­ های OQ۹۴۵۱۴۳ و OP۰۵۵۸۱۱ ثبت شدند. همزمان پیوند بر روی گیاه محک پروانش با هدف مخزن ذخیره ژن و مشاهده علائم فیتوپلاسما صورت گرفت. مقایسه توالی های به دست آمده با توالی های موجود در سایت NCBI توسط نرم افزار بر خط بلاست، بیشترین شباهت را به فیتوپلاسما­های Aster yellows phytoplasma نشان داد و آنالیز فیلوژنتیک توالی مد­نظر با الگوریتم تخمین درست ­نمایی بیشینه در مقایسه با زیر­گروه های مختلف فیتوپلاسمای گزارش شده در ایران نیز نتایج حاصل از بلاست را تایید کرد. همچنین مقایسه نقوش حاصل از RFLP مجازی، مشابه ­ترین الگوی مرجع گروه ۱۶SrI، زیرگروه AD (دسترسی GenBank: DQ۲۸۶۵۷۷)، با ضریب شباهت ۷۷/۰ را مشخص کرد که این موضوع نشان داد که این سویه ممکن است نشان­ دهنده یک گروه جدید باشد. نتایج این مطالعه حضور فیتوپلاسما را در درختان هلو استان گلستان برای اولین بار تایید نموده و نشان از حضور گونه فیتوپلاسمایی نزدیک به Candidatus phytoplasma asteris در استان گلستان دارد.

همراهی فیتوپلاسما Candidatus در درختان میوه هسته دار استان گلستان: گزارش یک مطالعه تشخیصی Keywords:

فیتوپلاسما , آنالیز فیلوژنتیکی , درختان میوه هسته دار , زردی و زوال هلو