شناسایی و آنالیز فیلوژنتیکی سویه های Vibrio harveyi جداشده از میگو های پرورشی سفید غربی (Litopenaeus vannamei Boone, ۱۹۳۱) - منطقه تیاب-هرمزگان

در مطالعه حاضر باکتری های Vibrio harveyi از هپاتوپانکراس میگوهای پرورشی سفید غربی Litopenaeus vannamei جمع آوری شده از منطقه تیاب جداسازی و شناسایی گردیدند. نمونه های میگو از دو مزرعه شامل ۵ استخر در سایت های تیاب شمالی و جنوبی جمع آوری شدند. مرحله جداسازی با رقیق سازی و تلقیح نمونه های هپاتوپانکراس با استفاده از محیط تیوسولفات سیترات بایل سوکروز آگار انجام گرفت. پس از خالص سازی، شناسایی فنوتیپی ایزوله های به دست آمده بر اساس خصوصیات مورفولوژیک، بیوشیمیایی و فیزیولوژیک انجام شد. به دنبال آن ۵ سویه منتخب Vibrio harveyi پس از استخراج DNA و تکثیر ژن ۱۶S rRNA مورد شناسایی ژنتیکی قرار گرفتند. مقایسه توالی ژن ۱۶S rRNA تکثیر شده از جدایه های منتخب با توالی های ثبت شده در بانک ژن NCBI با استفاده از نرم افزار Megablast ضمن تایید تعلق سویه های جدا شده به Vibrio harveyi بیانگر تشابه بالای سویه های جدا شده با سویه Vibrio harveyi  ATCC BAA-۱۱۱۶ بود. مطالعات آنالیز فیلوژنتیک با استفاده از نرم افزار  MEGA۶بر اساس روش Joining  Neighbour   نشان داد سویه های مورد بررسی دارای منشا منوفیلتیک یکسانی بودند. نتایج این مطالعه حضور گونه های Vibrio harveyi در هپاتوپانکراس میگوهای پرورشی سفید غربی منطقه تیاب را تایید نمود.

Keywords:

Vibrio harveyi , Litopenaeus vannamei , Genetic identification , Phylogenetic analysis , آنالیز فیلوژنتیک , شناسایی ژنتیکی , هپاتوپانکراس , Vibrio harveyi