مقایسه وابستگی اتصال ترکیبات سیاه دانه و شیرین بیان با رمدسیویر بر Mpro سارس کرونا ویروس۲ با استفاده از شبیه سازی دینامیک مولکولی هدایت شده
Publish place: JOURNAL OF MECHANICAL ENGINEERING، Vol: 53، Issue: 3
Publish Year: 1402
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 71
This Paper With 7 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_TUMECHJ-53-3_019
تاریخ نمایه سازی: 28 بهمن 1402
Abstract:
سارس کرونا ویروس ۲ منجر به بیماری کووید-۱۹ به عنوان یک بیماری همهگیر توسط سازمان جهانی بهداشت (WHO) گزارش شده است. در این ویروس یکی از پروتئازهای سیستئین ضروری که پروتئاز اصلی نامیده میشود، هدف دارویی مناسبی برای بسیاری از مهارکننده های گیاهی و شیمیایی است. بررسی وابستگی اتصال مهارکنندهها به پروتئاز اصلی سارس کرونا ویروس۲ یکی از عوامل تاثیرگذار در کارایی آنهاست. در این مقاله وابستگی اتصال داروهای گیاهی ازجمله نیجلیدین از گیاه سیاهدانه و لیکوریتیژنین از گیاه شیرینبیان بر پروتئاز اصلی از سارس کرونا ویروس ۲ با استفاده از شبیهسازی دینامیک مولکولی هدایتشده موردبررسی قرارگرفته و با داروی شیمیایی رمدسیویر مقایسه شده است. نتایج نشان دادند که در بین لیگاندهای گیاهی، نیجلیدین بیشترین نیروی جداشدگی را به خود اختصاص میدهد. این امر در حالی است که رمدسیویر به عنوان یک مهارکننده شیمیایی دارای بیشترین نیروی جداشدگی در مقایسه با مهارکنندههای گیاهی است. همچنین انرژی الکترواستاتیک و واندروالس برای مجموعه رمدسیویر و پروتئاز اصلی نسبت به سایر مهارکنندههای گیاهی مقدار منفیتری را نشان میدهد. بنابراین باوجود امتیاز اتصال بالای ترکیبات سیاهدانه و شیرینبیان، رمدسیویر تحت عنوان یک ترکیب شیمیایی وابستگی اتصال بیشتری را نشان میدهد.
Keywords:
سیاه دانه , شیرین بیان , پروتئاز اصلی , سارس کرونا ویروس ۲ , مهارکننده , شبیه سازی دینامیک مولکولی هدایت شده
Authors
محدثه عبیدی
دانشجوی دکتری، گروه مهندسی مکانیک و هوافضا، دانشگاه حکیم سبزواری، سبزوار، ایران
سارا هیات حسینیان
کارشناسی ارشد، گروه مهندسی مکانیک و هوافضا، دانشگاه حکیم سبزواری، سبزوار، ایران
رضا سهیلی فرد
دانشیار، گروه مهندسی مکانیک و هوافضا، دانشگاه حکیم سبزواری، سبزوار، ایران
رضا حسن زاده قاسمی
دانشیار، گروه مهندسی مکانیک و هوافضا، دانشگاه حکیم سبزواری، سبزوار، ایران
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :