بررسی تنوع ژنتیکی جمعیت های بومی هندوانه ایران با استفاده از نشانگر مولکولی ISSR
Publish place: Journal of agricultural biotechnology، Vol: 16، Issue: 1
Publish Year: 1403
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 99
This Paper With 18 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_JOAGK-16-1_001
تاریخ نمایه سازی: 29 بهمن 1402
Abstract:
هدف: هدف از انجام این تحقیق بررسی کارایی نشانگر مولکولی ISSR در تمایز جمعیت های هندوانه مورد مطالعه ، تعیین میزان تشابه و فاصله ژنتیکی جمعیت ها به منظور استفاده از پدیده هتروزیس و انتخاب والدین مناسب در برنامه های تولید بذر هیبرید هندوانه می باشد.مواد و روش ها: در این تحقیق تنوع ژنتیکی ۲۴ جمعیت مختلف هندوانه از سراسر ایران با استفاده از ۱۰ پرایمر ISSR مورد بررسی قرار گرفت. استخراج DNA با استفاده از روش CTAB انجام گرفت. پس از انجام PCR امتیاز دهی داده های مولکولی به صورت صفر و یک داده شد. شاخص های مرتبط با نشانگر شامل تعدادکل باندها، تعدادباندهای چندشکل، درصدچندشکلی، شاخص نشانگری ( MI ) ، شاخص قدرت تفکیک (RP) و محتوای اطلاعات چندشکلی(PIC) اندازه گیری شد. به منظور انجام تجزیه خوشه ای، از نرم افزار NTSYS و Excel و به منظور تجزیه واریانس مولکولی و تجزیه به مختصات اصلی نیز از نرم افزار GenALEx استفاده شد.نتایج: در این تحقیق در مجموع ۲۰۲ باند تولید شد که از این تعداد ۱۸۴ باند چندشکل بود. میانگین تعداد کل باند و باندهای چندشکل در این مطالعه به ترتیب ۲/۲۰ و ۴/۱۸ به دست آمد. بیشترین درصد چندشکلی مربوط به آغازگر ISSR۶ با ۱۰۰ درصد و کمترین میزان چندشکلی مربوط به آغازگر ISSR۵ با ۸۰ درصد بود. میانگین درصد چندشکلی در این مطالعه نیز ۹۰/۰ به دست آمد. مقدار شاخص PIC در این تحقیق بین ۲۶/۰ تا ۴۴/۰ متغییر و میانگین PIC نیز ۳۵/۰ بود. پس از انجام تجزیه خوشه ای جمعیت های مورد مطالعه در سطح تشابه ۵۵ درصد در پنج گروه قرار گرفتند. نتایج حاصل از تجزیه واریانس مولکولی و تجزیه به مختصات اصلی در جمعیت های مورد مطالعه نتایج نشان داد ۱۴ درصد از تنوع مربوط به بین جمعیت های مورد مطالعه و ۸۶ درصد از تنوع مربوط به درون جمعیت های مورد مطالعه می باشد. نتایج تجزیه به مختصات اصلی نیز نتایج حاصل از تجزیه خوشه ای را تایید کرد .نتیجه گیری: با توجه به نتایج به دست آمده نشانگر مولکولی ISSR کارایی لازم جهت تمایز جمعیت های مورد مطالعه را دارد و از طرفی با توجه به تنوع ژنتیکی قابل ملاحظه بین و درون جمعیت های مورد مطالعه از ژنوتیپهای استفاده از شده در این تحقیق می توان به عنوان جمعیت اولیه در برنامه های تولید بذر هیبرید هندوانه استفاده کرد و همچنین از جمعیت های فاریاب و میناب با توجه به اینکه بیشترین فاصله ژنتیکی را داشتند به منظور استفاده از هتروزیس در پروژه های تولید بذر هیبرید هندوانه به عنوان والدین تلاقی می توان استفاده کرد.
Keywords:
Authors
امین ارجمند
گروه آموزشی زراعت و اصلاح نباتات، دانشکدکان کشاورزی و منابع طبیعی ، دانشگاه تهران، تهران، ایران
محسن ابراهیمی
گروه آموزشی علوم زراعی و اصلاح نباتات ، دانشکده فناوری کشاورزی ابوریحان، دانشگاه تهران ، تهران ، ایران
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :