ESR۱ هدف جدیدی برای miR-۱۵a-۳p و lncRNA OIP۵-AS۱ و تحت تنظیم پلی مورفیسم rs۲۲۳۴۶۹۳ در بیماران مبتلا به سرطان پستان: ادغام رویکرد بیوانفورماتیک و تجربی
Publish Year: 1402
نوع سند: مقاله ژورنالی
زبان: Persian
View: 35
This Paper With 20 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
JR_JMUMS-33-230_005
تاریخ نمایه سازی: 19 اسفند 1402
Abstract:
سابقه و هدف: پس از بیماری های قلبی و تصادفات، سرطان به عنوان سومین عامل مرگ و میر در ایران و به عنوان یک مشکل عمده بهداشتی در بسیاری از کشورهای توسعه یافته و در حال توسعه در نظر گرفته می شود. در سرطان پستان، سلول های پستان بدون کنترل رشد می کنند. این بیماری بر اساس نوع سلول های پستان که سرطانی می شوند انواع مختلفی دارد. این سرطان حدود یک سوم انواع سرطان را در جمعیت زنان تشکیل می دهد و علت اصلی مرگ و میر ناشی از سرطان در زنان در سراسر جهان است. گیرنده استروژن-α یکی از ایزوفرم های گیرنده استروژن است که توسط ژن گیرنده استروژن (ESR۱)کدگذاری می شود. ESR-α یک گیرنده هسته ای است که به عنوان یک فاکتور رونویسی وابسته به لیگاند عمل می کند. پس از اتصال استروژن، ESR-α به نواحی پاسخ استروژن در پروموتر ژن های هدف متصل شده وسبب تغییر در بیان ژن های هدف می شود. مطالعه حاضر به بررسی سطح بیان ژن گیرنده استروژن (ESR۱) و RNAهای طولانی غیر کدکننده (lncRNAs) مرتبط با آن و بررسی فراوانی آلل و ژنوتیپ پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی (SNP) rs۲۲۳۴۶۹۳ در ژنESR۱ در بیماران مبتلا به سرطان پستان پرداخت.
مواد و روش ها: در این مطالعه موردی- شاهدی، بررسی بیان ESR۱ و RNA های کدکننده و غیرکدکننده مربوط به آن توسط میکروآرایه (۱۷ نمونه کنترل و ۱۰۴ نمونه بیمار)،TCGA RNAseq (بر روی ۱۱۳ نمونه نرمال، ۱۱۰۲ تومور اولیه و ۷ نمونه تومور متاستاتیک) انجام شد. آنالیز داده ها توسط R Studio و limma و پایگاه داده های ENCORI و GEPIA۲ صورت گرفت. ارزیابی تعامل microRNAها توسط miRWalk و یافتن برهمکنش lncRNA توسط lncBase ۳ انجام شد. برهمکنش پروتئین- پروتئین توسط STRING و آنالیز بقا و همبستگی توسطGEPIA۲ و ENCORI بررسی شدند. آنالیزهای غنی سازی مسیر و آنتولوژی ژنی (GO) توسطKEGG و Enrichr و بررسی SNP توسط آزمایش RFLP انجام شد.
یافته ها: بیان ژن ESR۱ در سرطا پستان افزایش داشت و ژن miR-۱۵a-۳p تعامل قابل توجهی با ESR۱ وlncRNA OIP۵-AS۱ داشت. OIP۵-AS۱ و ESR۱ در نمونه های بیمار بیان مثبت معنی داری داشتند. فراوانی ژنوتیپ های TC، TT و CC در افراد سالم به ترتیب ۶۵ ، ۱۵ و ۲۰ درصد و در گروه بیمار ۳۸/۵، ۳۸/۵ و ۲۳ درصد بود. تفاوت معنی داری در شیوع ژنوتیپ های ژن ESR۱ بین بیماران و کنترل وجود داشت.
استنتاج: پلی مورفیسم ESR۱ ممکن است با افزایش خطر ابتلا به سرطان پستان مرتبط باشد و rs۲۲۳۴۶۹۳ T>CSNP می تواند یک نشانگر قوی برای غربالگری سرطان پستان در نظر گرفته شود. OIP۵-AS۱ ممکن است پیشرفت سرطان پستان را با تغییر در تنظیم بیان ESR۱ تنظیم کند.
Keywords:
single nucleotide polymorphism , breast cancer , ESR۱ gene , RFLP-PCR , rs۲۲۳۴۶۹۳ , miRNA , ceRNA network , پلی مورفیسم تک نوکلئوتیدی , سرطان پستان , ژن ESR۱ , RFLP-PCR , rs۲۲۳۴۶۹۳ , miRNA , شبکه ceRNA
Authors
پردیس میرزاییان
PhD Student in Cellular and Molecular Biology, Department of Biology, Rasht Branch, Islamic Azad University, Rasht, Iran
محمد شکرزاده
Professor, Pharmaceutical Research Center, Department of Toxicology and Pharmacology, Mazandaran University of Medical Sciences, Sari, Iran and Faculty of Pharmacy, Mazandaran University of Medical Sciences, Sari, Iran
علی صالح زاده
Associate Professor, Department of Biology, Rasht Branch, Islamic Azad University, Rasht, Iran
فرزام عجمیان
Assistant Professor, Department of Biology, Faculty of Science, University of Guilan, Rasht, Iran
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :