استفاده از اطلاعات تعاملات پروتئین ها و اُنتولوژی ژن در بازسازی شبکه های تنظیم کننده ژنی
Publish place: 17th Iranian Conference on Biomedical Engineering
Publish Year: 1389
Type: Conference paper
Language: Persian
View: 1,325
This Paper With 6 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- I'm the author of the paper
Export:
Document National Code:
ICBME17_280
Index date: 30 June 2013
استفاده از اطلاعات تعاملات پروتئین ها و اُنتولوژی ژن در بازسازی شبکه های تنظیم کننده ژنی abstract
شبکه ی تنظیم کننده ی ژنی مجموعه ای از ژن ها می باشند که با هم و با مواد دیگر در سلول تعامل دارند و به این وسیله نرخ رونویسی ژن ها به mRNA کنترل می شود. میکروآرایه های DNA بیان هزاران ژن را به صورت همزمان اندازه گیری می ک نند. تکنیک های مختلفی برای مدلسازی شبکه های ژنی با استفاده از داده های بیان ژن میکروآرایه ارائه شده اند. با این وجود استفاده از فقط داده های میکروآرایه برای تخمین صحیح این شبکه ها کافی نیست، لذا روش هائی برای استفاده از انواع دیگر اطلاعات بیولوژیکی به همراه داده های میکروآرایه به منظور بهبود نتایج مدلسازی ارائه شده اند. در این مقاله، علاوه بر داده های میکروآرایه دو نوع دان بیولوژیکی دیگر (تعاملات پروتئین ها و آنتولوژی ژن) نیز در بازسازی شبکه های ژنتیکی با استفاده از شبکه ی بیژین به کار گرفته شده اند. مقایسه ی ارتباطات حاصل از پیاده سازی این روش روی 84 ژن مخمر، با ارتباطات شناخته شده ی موجود در پایگاه داده ی KEGG نشان می دهد که با استفاده از ترکیب سه منبع اطلاعاتی، صحت از 62% به 76% بهبود می یابد.
استفاده از اطلاعات تعاملات پروتئین ها و اُنتولوژی ژن در بازسازی شبکه های تنظیم کننده ژنی Keywords:
آنتولوژی ژن , تعاملات پروتئین ها , داده های سری زمانی میکروآرایه , شبکه ی بیزین , شبکه های تنظیم کننده ی ژنتیکی
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :