مطالعه تنوع ژنتیکی جمعیت های بنه (Pistacia atlantica Desf.) در جنگل های زاگرس بر اساس نشانگرهای مولکولی ISSR، IRAP و SCoT

H. Shah-Ghobadi; N. Shabanian; A. Khadivi; M. S. Rahmani

مطالعه تنوع ژنتیکی جمعیت های بنه (Pistacia atlantica Desf.) در جنگل های زاگرس بر اساس نشانگرهای مولکولی ISSR، IRAP و SCoT

Publish place: Iranian Journal of Rangelands and Forests Plant Breeding and Genetic Research، Vol: 26، Issue: 2

Publish Year: 1397

Type: Journal paper

Language: Persian

This Paper With 19 Page And PDF Format Ready To Download

DOWNLOAD Paper

Certificate
I'm the author of the paper

Export:

Link to this Paper:

https://civilica.com/doc/2076369

Document National Code:

JR_IJRFP-26-2_003

Index date: 19 September 2024

مطالعه تنوع ژنتیکی جمعیت های بنه (Pistacia atlantica Desf.) در جنگل های زاگرس بر اساس نشانگرهای مولکولی ISSR، IRAP و SCoT abstract

DOR: ۹۸.۱۰۰۰/۱۷۳۵-۰۸۹۱.۱۳۹۷.۲.۱۷۷.۵۲.۲۶.۱۶۰۵.۸۴ این مطالعه با هدف ارزیابی تنوع ژنتیکی درون و بین جمعیتی ۱۵ جمعیت بنه (Pistaciaatlantica) شامل ۱۸۱ ژنوتیپ در جنگل های زاگرس با استفاده از ۱۵، ۱۲ و ۱۳ آغازگر به ترتیب از نشانگرهای مولکولی توالی های تکراری ساده میانی (ISSR)، چندشکلی تکثیرشده بین رتروترانسپوزون ها (IRAP) و چندشکلی نواحی هدف کدون شروع (SCoT) انجام شد. در نشانگر ISSR، در مجموع ۱۸۶ نوار تکثیر شد که از این تعداد ۱۶۲ نوار (۸۷ درصد) چندشکل بودند. این برآوردها در نشانگرهای IRAP و SCoT به ترتیب ۱۴۳ و ۱۳۰ (۹/۹۰ درصد) و ۱۳۶ و ۱۲۰ (۸۸ درصد) بودند. بر اساس نتایج به دست آمده، هر سه نشانگر تنوع ژنتیکی بالایی را در سطح جمعیت نشان دادند (ISSR: ۲۲/۰ =h، درصد لوکوس های چندشکل= ۹۲/۶۱ درصد؛ IRAP: ۲۵/۰ =h، درصد لوکوس های چندشکل= ۱۹/۷۴ درصد؛ SCoT: ۲۰/۰ =h، درصد لوکوس های چندشکل= ۰۹/۶۴ درصد). مقدار عددی ضریب تمایز ژنتیکی بین جمعیتی (ΦSt) از نشانگرهای مورد استفاده یعنی ISSR، IRAP و SCoT به‎ترتیب برابر با ۲۸/۰، ۲۳/۰ و ۲۲/۰ محاسبه شد که نمایانگر بیشتر بودن سهم تنوع ژنتیکی درون جمعیت ها از تنوع ژنتیکی بین جمعیت هاست؛ و تجزیه واریانس مولکولی نیز آن را تایید کرد. ضعیف بودن تمایز ژنتیکی بین جمعیت ها در مقابل پایه های داخل جمعیت ها می تواند ناشی از جریان ژنی گسترده مبتنی بر گرده افشانی به‎کمک باد بین ژنوتیپ های بنه در گستره جغرافیایی این مطالعه باشد. تجزیه خوشه ای UPGMA مبتنی بر سه نشانگر مولکولی مورد استفاده، ۱۵ جمعیت P. atlanticaانتخاب شده برای این مطالعه را در خوشه های مجزا تفکیک کرد. آزمون مانتل همبستگی بین فاصله ژنتیکی جمعیت ها و فاصله جغرافیایی آنها را معنی دار نشان نداد.

مطالعه تنوع ژنتیکی جمعیت های بنه (Pistacia atlantica Desf.) در جنگل های زاگرس بر اساس نشانگرهای مولکولی ISSR، IRAP و SCoT Keywords:

بنه , جریان ژنی , ژنتیک جمعیت , IRAP , SCoT

مطالعه تنوع ژنتیکی جمعیت های بنه (Pistacia atlantica Desf.) در جنگل های زاگرس بر اساس نشانگرهای مولکولی ISSR، IRAP و SCoT authors

H. Shah-Ghobadi

دانش آموخته کارشناسی ارشد، جنگل شناسی و اکولوژی جنگل، دانشکده منابع طبیعی، دانشگاه کردستان

N. Shabanian

نویسنده و مسئول مکاتبات، دانشیار، دانشکده منابع طبیعی، دانشگاه کردستان پست الکترونیک: n.shabanian@uok.ac.com

A. Khadivi

دانشیار، گروه علوم باغبانی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه اراک

M. S. Rahmani

دانشجوی دکتری، بیوتکنولوژی گیاهی، پردیس کشاورزی و منابع طبیعی، گروه بیوتکنولوژی کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه تهران

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :

Alikhani, L., Rahmani, M.S., Shabanian, N., Badakhshan, H. and Khadivi-Khub, ...

Bihamta, M.R, Shabanian, N., Rahmani, M.S. and Vafaee, Y., ۲۰۱۵. ...

Biswas, M.S., Hassan, J. and Hossain, M.M., ۲۰۱۰. Assessment of ...

Bohonak, A.J., ۱۹۹۹. Dispersal, gene flow, and population structure. The ...

Debinski, D.M. and Holt, R.D., ۲۰۰۰. A survey and overview ...

Derero, A., Gailing, O. and Finkeldey, R., ۲۰۱۱. Maintenance of ...

Ding, G., Zhang, D., Ding, X., Zhou, W. and Li, ...

Doyle, J.J. and Doyle, J.L., ۱۹۸۷. A rapid DNA isolation ...

Excoffier, L., Smouse, P. and Quattro, J., ۱۹۹۲. Analysis of ...

Fortini, P., Viscosi, V., Maiuro, L., Fineschi, S. and Vendramin, ...

Hormaza, J.I., Dollo, L. and Polito, V.S., ۱۹۹۴. Determination of ...

Iranjo, P., NabatiAhmadi, D., Sorkheh, K., Rajabi Memeari, H. and ...

Kafkas, S. and Perl-Treves, R., ۲۰۰۱. Morphological and molecular phylogeny ...

Kafkas, S., Cetiner, S. and Perl-Treves, R., ۲۰۰۱. Development of ...

Kercher, S.M. and Sytsma, K.J., ۲۰۰۰. Genetic and morphological variation ...

Khatamsaz, M., ۱۹۸۸. Studies on the Rosaceae family in Iran, ...

Kramer, A.T., Ison, J.L., Ashley, M.V. and Howe, H.F., ۲۰۰۸. ...

Mantel, N., ۱۹۶۷. The detection of disease clustering and a ...

Nei, M., ۱۹۷۸. Estimation of average heterozygosity and genetic distance ...

Peakall, R. and Smouse, P.E., ۲۰۰۶. GenAlEx۶: genetic analysis in ...

Rahmani, M.S., Shabanian, N., Khadivi-Khub, A., Woeste, K.E., Badakhshan, H. ...

Roncal, J., Francisco-Ortega, J. and Lewis, C.E., ۲۰۰۷. An evaluation ...

Salehi Shanjani, P., Mardi, M., Pazouki, L., Hagidimitriou, M., Avanzato, ...

Salehi Shanjani, P., Vendramin, G.G. and Calagari, M., ۲۰۱۰. Genetic ...

Shaffer, M., ۱۹۸۱. Minimum population sizes for species conservation. BioScience, ...

Sreekumar, V.B. and Renuka, C., ۲۰۰۶. Assessment of genetic diversity ...

Tayefeh Aliakbarkhany, S., Talaie, A.R. and Fatahi Moghadam, M.R., ۲۰۱۳. ...

Thriveni, H.N., Sumangala, R.C., Shivaprakash, K.N., Ravikanth, G., Vasudeva, R. ...

Valipour, A., Plieninger, T., Shakeri, Z., Ghazanfari, H., Namiranian, M. ...

Vogel, J.M., Rafalski, A., Powell, W., Morgante, M., Andre, C., ...

Wong, K.C. and Sun, M., ۱۹۹۹. Reproductive biology and conservation ...

procera (Orchidaceae). American Journal of Botany, ۸۶: ۱۴۰۶–۱۴۱۳.. ...

Wright, S., ۱۹۵۱. The genetical structure of populations. Annals of ...

Zolfaghari, R., Akbarinia, M., Mardi, M. and Ghanati, F., ۲۰۰۹. ...

نمایش کامل مراجع