جداسازی، تعیین خصوصیت و تحلیل بیان ژن ۴’OMT۲ گیاه دارویی شقایق
Publish place: Iranian Journal of Rangelands and Forests Plant Breeding and Genetic Research، Vol: 26، Issue: 2
Publish Year: 1397
Type: Journal paper
Language: Persian
View: 63
This Paper With 12 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- I'm the author of the paper
Export:
Document National Code:
JR_IJRFP-26-2_002
Index date: 19 September 2024
جداسازی، تعیین خصوصیت و تحلیل بیان ژن ۴’OMT۲ گیاه دارویی شقایق abstract
DOR: ۹۸.۱۰۰۰/۱۷۳۵-۰۸۹۱.۱۳۹۷.۲.۱۶۵.۵۲.۲۶.۱۵۸۰.۳۲ گیاه شقایق (Papaver somniferum L.) یکی از مهمترین گیاهان دارویی جهان بوده و چندین آلکالوئید بنزیل ایزوکوئینولینی دارویی مهم را تولید می کند. در این پژوهش ژن ۴’OMT۲ (۳′-hydroxy-N-methylcoclaurine ۴′-O-methyltransferase) از این گیاه جداسازی، تعیین توالی و تعیین خصوصیت شد. پس از تکثیر توالی کدکننده و ژنومیک ژن ۴’OMT۲با استفاده از PCR، این قطعات در پلاسمید pTZ۵۷R/T همسانهسازی و تعیین توالی شدند. نتایج توالی یابی قطعاتی با طول ۱۰۷۴ و ۱۱۸۹ جفت بازی را بهترتیب برای توالی کدکننده و ژنومیک نشان داد. برای اولین بار در این گیاه، نتایج وجود یک اینترون با طول ۱۱۵ جفت باز را در توالی ژنومیک ژن ۴’OMT۲نشان داد. ژن جداسازی شده از ژنوتیپ ایرانی با همسانی بسیار بالایی به ژن ۴’OMT۲جنس شقایق شباهت داشت و با همسانی بیشتر از ۶۷ درصد به گیاهان راسته آلاله سانان شبیه بود. بررسی های بیوانفورماتیکی بیشتر نشان داد که ژن ۴’OMT۲آنزیمی پایدار را تولید می کند که بدون سیگنال پپتید بوده و در سیتوپلاسم تجمع پیدا می کند. برای بررسی آنالیز بیان ژن، پنج کتابخانه از داده های SRA (نوع mRNA) گیاه شقایق مربوط به ترانسکریپتوم جوانه گل، برگ، میوه در حال نمو، ساقه و ریشه از پایگاه SRA دریافت و بیان ژن جداسازی شده ۴’OMT۲در آنها با استفاده از نرمافزار IDEG۶ و آزمون های آماری بررسی شد. نتایج نشان داد که این ژن دارای بیان متفاوتی در بافت های مختلف گیاه شقایق بوده و بیشترین میزان بیان را در بافت ساقه دارد. شناسایی توالی کدکننده ژن های بیوسنتزی و بررسی خصوصیات آنها اولین قدم در دستورزی ژنتیکی و بهرهگیری در مهندسی متابولیک است. در این پژوهش برای اولین بار توالی کدکننده کامل ژن ۴’OMT۲از گیاه شقایق جداسازی شد و وجود یک اینترون در ساختار آن مشخص و اثبات شد.
جداسازی، تعیین خصوصیت و تحلیل بیان ژن ۴’OMT۲ گیاه دارویی شقایق Keywords:
جداسازی، تعیین خصوصیت و تحلیل بیان ژن ۴’OMT۲ گیاه دارویی شقایق authors
S. M. Sohrabi
دانشجوی دکتری، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرم آباد
A. Ismaili
نویسنده مسئول مکاتبات، دانشیار، گروه زراعت و اصلاح نباتات، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرم آباد پست الکترونیک: ismaili.a@lu.ac.ir
F. Nazarian Firouz-Abadi
استاد، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرم آباد
K. Samiei
دانشجوی دکتری، دانشکده کشاورزی، دانشگاه لرستان، خرم آباد
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
