شناسایی کاندید های دارویی جدید آنزیم ترانس کریپتاز معکوس ویروس ایدز در محل جایگاه فعال با غربالگری مجازی مبتنی بر داکینگ مولکولی و مکانیک کوانتومی

ایدز (سندروم نقص ایمنی اکتسابی) یک وضعیت شدید و پیشرفته از عفونت ویروس نقص ایمنی انسانی (HIV) است که باعث ضعف سیستم ایمنی بدن می شود و برای عفونت های فرصت طلب و برخی از انواع سرطان ها پیش زمینه فراهم می کند. چرخه حیاتی HIV  شامل چندین آنزیم است که در تکثیر ویروس نقش دارند. یکی از این آنزیم ها، ترانس کریپتاز معکوس نام دارد. برای مدیریت بهتر درمان، معمولا از ترکیبات درمانی مانند HAART استفاده می شود که از ترکیب چندین دارو تشکیل شده است تا بهبود اثربخشی درمان و کاهش مقاومت دارویی را فراهم آورد. در این مطالعه، با هدف ارزیابی داروهای نویراپین، رالتگراویر، ایندیناویر و کاندید های دارویی جدید در مهار آنزیم ترانس کریپتاز معکوس، ابتدا ساختارهای دارویی به روش های محاسباتی B۳LYP و مجموعه پایه ی ۶-۳۱۱G بهینه سازی شدند و پارامترهای ترمودینامیکی مرتبط با آن ها محاسبه گردید. همه ترکیبات از مجموعه داده و ترکیبات طراحی شده برای پیش بینی ADMET استفاده شدند تا ویژگی های آن ها بررسی شود و همچنین برای ارزیابی داروهای بالقوه استفاده گردد. در پایان، با استفاده از شبیه سازی های داکینگ مولکولی، اثر مهارکنندگی نویراپین، رالتگراویر، ایندیناویر و کاندید های دارویی جدیدNVP۲، RAL۲ وIND۲  با بهترین انرژی بایندینگ -۹.۳۴، -۱۱.۲۸ و -۹.۳۰  بر آنزیم ترانس کریپتاز معکوس مورد ارزیابی قرار گرفت. تحلیل های انجام شده در طول شبیه سازی نشان داد که ترکیبات NVP۲، RAL۲ وIND۲  به خوبی در مهار آنزیم ترانس کریپتاز معکوس ویروس HIV-۱ عمل می کنند.

شناسایی کاندید های دارویی جدید آنزیم ترانس کریپتاز معکوس ویروس ایدز در محل جایگاه فعال با غربالگری مجازی مبتنی بر داکینگ مولکولی و مکانیک کوانتومی Keywords:

آنزیم ترانس کریپتاز معکوس , داکینگ مولکولی , سندروم نقص ایمنی اکتسابی , طراحی دارو , م ترانس کریپتاز معکوس , داکینگ مولکولی , سندروم نقص ایمنی اکتسابی , طراحی دارو