بازسازی و مدل سازی شبکه متابولیک تلفیقی از سیانوباکتر برای افزایش تولید سوخت زیستی
Publish place: Modares Journal of Biotechnology، Vol: 9، Issue: 2
Publish Year: 1397
Type: Journal paper
Language: Persian
View: 70
This Paper With 7 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- I'm the author of the paper
Export:
Document National Code:
JR_BIOT-9-2_005
Index date: 24 December 2024
بازسازی و مدل سازی شبکه متابولیک تلفیقی از سیانوباکتر برای افزایش تولید سوخت زیستی abstract
اهداف: در چند دهه اخیر تولید سوخت های زیستی یکی از تلاش های امیدبخش در عرصه زیست فناوری بوده است. سیانوباکترهای تک سلولی، میکروارگانیزم های بسیار پراکنده و فتوتروفیکی هستند که قادرند به عنوان کارخانجات کوچک تولیدکننده سوخت های زیستی عمل کنند. هدف مطالعه حاضر بازسازی و مدل سازی شبکه متابولیکی تلفیقی از سیانوباکتر به منظور افزایش تولید سوخت زیستی بود.
مواد و روش ها: در مطالعه محاسباتی حاضر یک نرم افزار برای ادغام شبکه های متابولیکی بازسازی شده، به منظور بهینه سازی و افزایش کارآیی آنها توسعه یافت و به اسم iMet نام گذاری شد. ابتدا از iMet برای ادغام سه شبکه متابولیکی از قبل بازسازی شده سینکوسیستیس ۶۸۰۳ PCC (Synechocystis PCC۶۸۰۳) استفاده شد. در مرحله بعد، شبکه بازسازی شده به دست آمده، برای تولید چهار نوع سوخت زیستی شامل اتانول، پروپانول، بوتانول و ایزوبوتانول مدل سازی شد.
یافته ها: مدل جدید ادغام شده ۸۰۸ واکنش و ۵۶۰ متابولیت داشت. مقدار فلاکس یا جریان آن در مدل ادغام شده، ۰۲۹۵/۰ بر ساعت محاسبه شد. این عدد نسبت به سه مدل قبلی افزایش قابل توجهی نشان داد. سلول ها تقریبا هر ۲۴ساعت، یک بار تقسیم شدند. میزان فلاکس چهار نوع الکل و حداکثر بازده تئوری آنها در مدل ادغام شده نسبت به سه مدل قبلی افزایش نشان داد. فلاکس تولید اتانول در تمامی مدل ها از فلاکس سه الکل دیگر بزرگ تر و واکنش های تولید اتانول به جریان یا فلاکس مرکزی کربن از همه نزدیک تر بود.
نتیجه گیری: آنالیزهای تعادل جریان افزایش پوشش شبکه متابولیک، افزایش تولید سوخت های زیستی و کاهش تعداد واکنش های بلوکه شده را در مدل جدید نشان می دهد و از این طریق کارآیی نرم افزار توسعه یافته iMet اثبات می شود.
بازسازی و مدل سازی شبکه متابولیک تلفیقی از سیانوباکتر برای افزایش تولید سوخت زیستی Keywords:
Metabolic Network , Cyanobacteria , Synechocystis sp. PCC ۶۸۰۳ , Algorithm , شبکه متابولیک , سیانوباکتری , سینکوسیستیس ۶۸۰۳ PCC , الگوریتم
بازسازی و مدل سازی شبکه متابولیک تلفیقی از سیانوباکتر برای افزایش تولید سوخت زیستی authors
رضا محمدی
Bioscience & Biotechnology Department, Malek Ashtar University of Technology, Tehran, Iran
جواد جواد ظهیری
Biophysics Department, Biological Science Faculty, Tarbiat Modares University, Tehran, Iran
محمدجواد نیرومند
Computer Engineering Department, Electrical & Computer Engineering Faculty, University of Tehran, Tehran, Iran
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
