پیری سلول های بنیادی مزانشیمی: بررسی نقش فروپتوز با استفاده از آنالیزهای بیوانفورماتیکی
Publish place: Nova Biologica Reperta، Vol: 11، Issue: 3
Publish Year: 1403
Type: Journal paper
Language: Persian
View: 77
This Paper With 16 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- I'm the author of the paper
Export:
Document National Code:
JR_NBR-11-3_003
Index date: 31 December 2024
پیری سلول های بنیادی مزانشیمی: بررسی نقش فروپتوز با استفاده از آنالیزهای بیوانفورماتیکی abstract
فروپتوز بعنوان نوعی از مرگ برنامهریزی شده سلولی تازه شناخته شده وابسته به آهن ارتباط زیادی با پیری دارد. هدف از این مطالعه بررسی نقش فروپتوز در پیری سلولهای بنیادی مزانشیمی (MSCs) میباشد. مجموعه داده GSE۹۷۳۱۱ (حاوی دادههای بیان MSCs جنینی و بالغ) آنالیز شده و ژن های دارای بیان افتراقی (DEGs) استخراج شدند. سپس از بین آنها، ژن های دارای بیان افتراقی مرتبط با فروپتوز (FRDEGs) تعیین شدند. در مرحله بعد با استفاده از روشهای بیوانفورماتیکی مختلف عملکردهای زیستی، برهمکنش پروتئین-پروتئین، ژنهای هاب، تنظیم کننندههای بالادست و همچنین فاکتورهای التهابی مرتبط با FRDEGs آنالیز شدند. طبق آنالیزها تعداد ۳۴ ژن بعنوان FRDEGs شناسایی شدند. تجزیه و تحلیل عملکردهای زیستی نشان داد که این ژنها بیشتر در فعالیتهای اکسیدوردوکتازی، سنتز اسیدهای چرب و پاسخ به یون آهن نقش دارند. همچنین، آنالیزهای مربوط به مسیرهای سیگنالدهی نیز نشان داد که این ژن ها بیشتر در مسیرهای مربوط به انواع سرطانها و همچنین بیوسنتز اسیدهای چرب درگیر هستند. طبق آنالیزها miR-۲۶b-۵p بعنوان مهمترین miRNA و LINC۰۰۲۰۵ و GAS۵ بعنوان مهمترین lncRNAها شناخته شدند. ژن های هاب شامل HMOX۱، EZH۲، NEDD۴L، PTGS۲، CDKN۲A، ATF۳، NOX۴، TXNIP، SNCA و MAPK۳ بعنوان ژن های اصلی فروپتوز مرتبط با پیری MSCs شناسایی شدند. نتایج احتمال مشارکت بالای FRDEGs و تنظیم کنندههای بالا دست آنها در القا التهاب و فنوتیپ پیری در MSCs را نشان دادند. این یافتهها ممکن است سرنخهای جدیدی برای بهبود عملکرد MSCs و کاهش بیماریهای مرتبط با افزایش سن در آینده ارائه دهد.
پیری سلول های بنیادی مزانشیمی: بررسی نقش فروپتوز با استفاده از آنالیزهای بیوانفورماتیکی Keywords:
mesenchymal stem cells , ferroptosis , aging , inflammation , miRNAs , lncRNAs , سلول های بنیادی مزانشیمی , فروپتوز , پیری , التهاب , miRNAs , lncRNAs
پیری سلول های بنیادی مزانشیمی: بررسی نقش فروپتوز با استفاده از آنالیزهای بیوانفورماتیکی authors
laleh mavaddatiyan
Shahid Beheshti University
mahmood talkhabi
Shahid Beheshti University
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :