ارزیابی تنوع ژنتیکی ژنوتیپ های سیاه شور مصری (Hasselq.) Zohary Suaeda aegyptiaca در استان خوزستان با استفاده از نشانگرهای مولکولی SCoT

زهرا حقیقی پور; مسعود (اشکبوس) دهداری; فاطمه ناصرنخعی; رضا امیری فهلیانی

ارزیابی تنوع ژنتیکی ژنوتیپ های سیاه شور مصری (Hasselq.) Zohary Suaeda aegyptiaca در استان خوزستان با استفاده از نشانگرهای مولکولی SCoT

Publish place: Journal of agricultural biotechnology، Vol: 16، Issue: 4

Publish Year: 1403

Type: Journal paper

Language: Persian

This Paper With 22 Page And PDF Format Ready To Download

DOWNLOAD Paper

Certificate
I'm the author of the paper

Export:

Link to this Paper:

https://civilica.com/doc/2169050

Document National Code:

JR_JOAGK-16-4_005

Index date: 2 February 2025

ارزیابی تنوع ژنتیکی ژنوتیپ های سیاه شور مصری (Hasselq.) Zohary Suaeda aegyptiaca در استان خوزستان با استفاده از نشانگرهای مولکولی SCoT abstract

هدف: سیاه شور مصری با نام علمی Suaeda aegyptiaca (Hasselq.) Zohary گیاهی هالوفیت است که کاربردهای تغذیه ای و دارویی زیادی دارد. نظر به اینکه تا کنون مطالعه ای در خصوص بررسی و تخمین تنوع ژنتیکی گیاه سیاه شور در استان خوزستان انجام نشده است، این مطالعه با هدف بررسی تنوع و روابط ژنتیکی بین ژنوتیپ های خودرو سیاه-شور در استان خوزستان طراحی و اجرا شد.مواد و روش ها: برای انجام مطالعات مولکولی از بین ۷۱ نمونه جمع آوری شده ۲۶ ژنوتیپ که دارای DNA ی مناسب بودند و در دو ناحیه بیشترین پراکنش داشتند تحت عنوان گروه های یک و دو انتخاب شدند. جهت بررسی تنوع و روابط ژنتیکی بین و داخل ژنوتیپ ها از ۱۲ آغازگر SCoT استفاده شد. بعد از استخراج DNA و انجام PCR، امتیازبندی ژنوتیپ ها به صورت صفر (عدم نوار) و یک (وجود نوار) انجام شد و تعداد کل نوارها، تعداد نوارهای چندشکل، درصد نوارهای چندشکل، تعداد افراد دارای نوار، شاخص اطلاع دهی نوار، قدرت تفکیک، محتوای اطلاعات چندشکل، نسبت سهم موثر و شاخص نشانگر محاسبه شدند.نتایج: در مجموع ۱۰۳ نوار تشکیل شد که درصد چندشکلی بالایی را نشان دادند. بیشترین میزان اطلاعات چندشکل (PIC) متعلق به ۱۴ SCoT (۴۳/۰) و ۱ SCoT(۳۳/۰)، شاخص نشانگری(MI) متعلق به ۱۴ SCoT (۳۶/۴) و بالاترین میزان قدرت تفکیک (Rp) مربوط به ۱۳SCoT (۳۸/۱۳) بود. مقادیر شاخص های تنوع ژنی نی (h)۹۲/۰، شانون (I) ۳۲۰/۰، شاخص تثبیت (Fst) ۰۹۲/۰ و جریان ژنی (Nm) ۸۷۲/۰ بدست آمدند. تجزیه خوشه ای به روش UPGMA ژنوتیپ ها را در پنج گروه قرار داد. در گروه اول ۱۹ ژنوتیپ، در گروه دوم چهار ژنوتیپ و در سه گروه دیگر هرکدام یک ژنوتیپ قرار گرفتند. نتایج گروه بندی حاصل از تجزیه به مختصات اصلی با تجزیه خوشه ای همخوانی داشته و گروه بندی تقریبا مشابهی را ارائه دادند. ژنوتیپ های KAR۲ ( کارون ۲) و GH۱ (غیزانیه) را که بیشترین فاصله ژنتیکی از هم داشتند، جهت ادامه برنامه های به نژادی مناسب می باشند. تجزیه واریانس مولکولی (AMOVA) نشان داد که تنوع ژنتیکی درون گروه ها از بین گروه ها بیشتر بود.

ارزیابی تنوع ژنتیکی ژنوتیپ های سیاه شور مصری (Hasselq.) Zohary Suaeda aegyptiaca در استان خوزستان با استفاده از نشانگرهای مولکولی SCoT Keywords:

تنوع ژنتیکی , ژرم پلاسم , سیاه شور مصری , شاخص نشانگر

ارزیابی تنوع ژنتیکی ژنوتیپ های سیاه شور مصری (Hasselq.) Zohary Suaeda aegyptiaca در استان خوزستان با استفاده از نشانگرهای مولکولی SCoT authors

زهرا حقیقی پور

دانشجوی کارشناسی ارشد، دانشگاه یاسوج، یاسوج، ایران.

مسعود (اشکبوس) دهداری

دانشگاه یاسوج دانشگاه یاسوج-دانشکده کشاورزی

فاطمه ناصرنخعی

استادیار، دانشگاه شهید چمران، اهواز، ایران.

رضا امیری فهلیانی

دانشیار، دانشگاه یاسوج، دانشکده کشاورزی، یاسوج، ایران

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :

ابراهیمیان مهسا، ابراهیمی محسن، مرتضویان سیدمحمدمهدی، رامشینی حسین (۱۳۹۶) بررسی ...

اسدی مصطفی (۱۳۹۸) فلور ایران. طبیعت ایران ۴ (۲)، ۲۹-۴۱ ...

پاکدل گیگلو فهیمه (۱۴۰۰) بررسی بیوسیستماتیکی جنس Adonis L. با ...

دیناروند مهری (۱۳۹۹) فلور استان خوزستان. انتشارات موسسه تحقیقات جنگلها ...

زمانی نوید، زمانی وحید، میرزایی خالد (۱۳۹۵) بررسی تنوع ژنتیکی ...

شعبانیان نقی، علیخانی لیلا، رحمانی محمدشفیع (۱۳۹۴). تنوع فنوتیپی و ...

شقاقی جواد، کردنائیج علاءالدین، قادری اردشیر (۱۳۹۸) ارزیابی تنوع ژنتیکی ...

طحانی لیلا، کوهیدهکردی مهرانا، دهقان زاده حمید (۱۳۹۸). بررسی تنوع ...

فرشادفر محسن، شیروانی هومن، امجدیان مصطفی، یاقوتی پور آنیتا (۱۳۹۷) ...

نوریان عبدالمهدی (۱۳۹۹). بررسی تنوع ژنتیکی در بین ژنوتیپهای گیاه ...

Agarwal A, Gupta V, Haq SU, Jatav PK, et al. ...

Akhani H (۲۰۰۶) Biodiversity of halophytic and sabkha ecosystems in ...

Assadi M (۲۰۱۹) Flora of Iran. Irannature ۴(۲), ۲۹-۴۱ ...

Collard BC, Mackill DJ (۲۰۰۹) Start codon targeted (SCoT) polymorphism: ...

Davis TM, Yu H, Haigis KM, McGowan PJ (۱۹۹۵) Template ...

Dinarvand M (۲۰۲۱) Flora of Khuzestan Provinces, Ground cover plants, ...

Ebrahimiyan M, Ebrahimi M, Mortazavian SM, Ramshini H (۲۰۱۷) The ...

Farshadfar M, Shirvani H, Amjadian A, Yaghotipoor A (۲۰۱۸) Application ...

Jalilian H, Zarei A, Erfani-Moghadam J (۲۰۱۸) Phylogeny relationship among ...

Jelvehgar N, Miri SM, Mostafavi K, et al. (۲۰۲۱) Assessing ...

Khang, NHM, Quang, NT, Mai, HNX et al. (۲۰۲۲) Genetic ...

Khodadadi S, Dashti H, Saberi R, et al. (۲۰۲۱) Genetic ...

Luo C, He XH, Chen H, et al. (۲۰۱۲). Genetic ...

Mahjbi A, Baraket G, Oueslati A, Salhi-Hannachi A (۲۰۱۵) Start ...

Milbourne D, Meyer R, Bradshaw, JE et al. (۱۹۹۷) Comparison ...

Mohammadi R, Cheghamirza K, Akbari D, Amiri H et al ...

Nei M (۱۹۷۲) Genetic distance between populations. Am Nat ۱۰۶(۹۴۹), ...

Nevo E (۱۹۹۸) Genetic diversity in wild creals: regional and ...

Noorian AM (۲۰۲۰) Genetic variation among Iranian genotypes of Malva ...

Pakdel F (۲۰۲۱) Biosystematic study of Adonis L. genuse basid ...

Peakall R, Smouse PE (۲۰۰۶) GENALEX ۶: genetic analysis in ...

Rincon F, Johnson B, Crossa J, Taba S. (۱۹۹۶) Cluster ...

Rahimi M, Nazari L, Kordrostami M, Safari, P (۲۰۱۸) SCoT ...

Rohlf, FJ (۱۹۸۷) NTSYS-pc: Micro-computer programs for numerical taxonomy and ...

Schaal BA, Hayworth DA, Olsen KM et al. (۱۹۹۸) Phylogeographic ...

Shabaniyan N, Alikhani L, Rahmani MS (۲۰۱۵) Phenotypic and genotypic ...

Shaghaghi J, Qaderi A, Kordenaeej A (۲۰۱۹) Evaluation of genetic ...

Shannon CE (۱۹۴۸) The mathematical theory of communication. Bell Syst ...

Tahani L, Koohi Dehkordi M, Dehghanzade H (۲۰۱۹) Evaluation of ...

Xiong F, Zhong R, Han Z, et al. (۲۰۱۱) Start ...

Yeh FC, Yang RC, Boyle T (۱۹۹۹) POPGENE Version ۱.۳۲: ...

Zamani N, Zamani V, Mirzaei K (۲۰۱۶) Genetic diversity analysis ...

نمایش کامل مراجع