مطالعهی ویژگی های پروتئینی و ساختار اگزون-اینترونی اعضای خانواده ژنی WRKY در گیاه نخود با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی

زهرا سطوتی; حمید حاتمی ملکی; ناصر زارع; سکینه پادیاب

مطالعهی ویژگی های پروتئینی و ساختار اگزون-اینترونی اعضای خانواده ژنی WRKY در گیاه نخود با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی

Publish place: 1ST International congress of Nature-based ecological restoration (Emphasizing the conservation of Bactrian camels)

Publish Year: 1403

Type: Conference paper

Language: Persian

This Paper With 8 Page And PDF Format Ready To Download

DOWNLOAD Paper

Certificate
I'm the author of the paper

Export:

Link to this Paper:

https://civilica.com/doc/2189582

Document National Code:

NERUMA01_035

Index date: 3 March 2025

مطالعهی ویژگی های پروتئینی و ساختار اگزون-اینترونی اعضای خانواده ژنی WRKY در گیاه نخود با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی abstract

نخود (Cicer arietinum) به عنوان یکی از حبوبات اصلی، در تامین پروتئین گیاهی و بهبود کیفیت خاک نقش مهمی دارد. مطالعه حاضر به بررسی و تحلیل اعضای خانواده ژنی WRKY در نخود پرداخته است تا نقش این ژن ها در پاسخ به تنش های محیطی و بهبود ویژگی های زراعی گیاه را کند. برای شناسایی اعضای خانواده WRKY در نخود، توالی های ژن های WRKY از پایگاه داده آرابیدوپس (Arabidopsis TAIR) استخراج شد و با استفاده از ابزار tBlastn در پایگاه داده NCBI جستجو گردید. برای شناسایی و تحلیل دمینهای حفاظتی WRKY، از نرم افزار SMART بهره بردیم که به شناسایی ساختارهای پروتئینی کمک می کند. ژن های شناسایی شده با پیشوند "Ca" نامگذاری شدند و بر اساس موقعیت کروموزومی شماره گذاری شدند. تحلیل ساختار اگزون-اینترون با استفاده از نرم افزار GSDS انجام شد که ساختار اگزون ها و اینترون ها را بررسی و فاز اینترونی را تعیین کرد. برای تعیین ویژگی های پروتئینی، از سرور ProtParam استفاده شد که اطلاعاتی درباره نقطه ایزوالکتریک یک، طول پروتئین و وزن مولکولی پروتئین ها ارائه می دهد. نتایج نشان داد که ژن های WRKY در نخود عمدتا در هسته و کلروپلاست ها قرار دارند و در کروموزوم های مختلف توزیع شده اند. طول پروتئین ها از ۱۵۹ تا ۱۰۰۹ آمینواسید و وزن مولکولی آنها از ۱۸۴۸.۴۶ تا ۱۱۶۲۲۱ دالتون متغیر است، که نشاندهنده تنوع باالی این پروتئین ها است. مقادیر pI نیز از ۴.۷۵ تا ۱۰.۵۴ متغیر است. در تحلیل ساختار اگزون-اینترون، ۴۷ ژن با تعداد مساوی از اگزون ها و اینترون ها شناسایی شد که به وجود یک الگوی ساختاری خاص در خانواده ژن های WRKY اشاره دارد. ژن هایی با ساختار پیچیده تر، دارای تعداد زیاد اگزون ها و اینترون ها هستند که می تواند به تنظیم دقیق تری از بیان ژن ها منجر شود. در مقابل، ژن هایی با ساختار ساده تر، تعداد کم اگزون ها و اینترون ها دارند و ممکن است به سرعت باالتر در فرآیندهای رونویسی و ترجمه منجر شوند. نتایج این مطالعه به درک بهتر از تنوع ژنتیکی و ساختاری خانواده ژنی WRKY در نخود کمک کرده و اطلاعات ارزشمندی را در زمینه توسعه استراتژی های جدید برای اصلاح نژاد و بهبود مقاومت نخود به شرایط محیطی مختلف ارائه می دهد. این تحلیل ها می تواند به بهبود ویژگی های زراعی نخود و افزایش پایداری آن در برابر تنش های محیطی کمک کند.

مطالعهی ویژگی های پروتئینی و ساختار اگزون-اینترونی اعضای خانواده ژنی WRKY در گیاه نخود با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی Keywords:

نخود , خانواده ژنی WRKY , تنش های محیطی , ساختار اگزون-اینترون

مطالعهی ویژگی های پروتئینی و ساختار اگزون-اینترونی اعضای خانواده ژنی WRKY در گیاه نخود با استفاده از ابزارهای بیوانفورماتیکی authors

زهرا سطوتی

دانشجوی ارشد ژنتیک و به نژادی گیاهی، گروه تولید و ژنتیک گیاهی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه مراغه، ایران

حمید حاتمی ملکی

استاد، گروه تولید و ژنتیک گیاهی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه مراغه، ایران

ناصر زارع

استاد، گروه تولید و ژنتیک گیاهی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه محقق اردبیلی، ایران

سکینه پادیاب

دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی کشاورزی، گروه تولید و ژنتیک گیاهی، دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی، دانشگاه محقق اردبیلی، ایران