از جمله بحثهای مطرح در فلسفه علم اخلاق خاستگاه علم اخلاق عموما و منبع دانش اخلاق حرفه ای پزشکی و منبع اخذ دانش اخلاق و قوانین اخلاقی است. بر اساس آموزه های اسلامی مهمترین منبع برای اخلاق، به ویژه اخلاق حرفه ای پزشکی، فطرت و
عقل است و آنچه در دین آمده، تبیین و تفسیر آن چیزی است که در امور اخلاقی، فطرت و
عقل به آن رسیده یا باید میرسیدند. از همین رو، از دیدگاه نویسنده نخستین منبع برای دانش اخلاق
عقل و بنای عقال است، و در ادامه به وحی و آموزه های وحیانی می رسیم. طبق آیه شریفه "فالهمها فجورها وتقواها؛ (شمس/ ۸ ) ما به انسانها کارهای شر و خیرش را الهام کردیم" و برداشت از سخن معصومین: که
عقل را به عنوان حجت و پیامبر باطنی معرفی مینمایند؛ ارزش و اهمیت
عقل کامال آشکار می گردد، از طرفی استاندارد جهانی اصول اخلاقی-انسانی مانند: SA۸۰۰۰ و AA۱۰۰۰, ISO ۸۰۰۰ و همه استانداردهای بین المللی که بر مبنای مراعات حقوق دیگران است؛ بیانگر جایگاه
عقل به عنوان مهمترین منبع اخلاق حرفه ای پزشکی و سایر علوم و مسایل مبتالبه می باشد. منتها از جهت تقدم رتبه های و ارزشی در بیان منابع اخلاق حرفه ای پزشکی؛ به ترتیب قرآن و سنت،
عقل و اجماع و بنای عقال است که به هر یک در حد تناسب اشاره خواهد شد.