شناسایی مجتمع های پروتئینی با استفاده از الگوریتم خوشه بندی مارکوف
Publish place: Conference on Computer Engineering and Sustainable Development with a focus on computer networking, modeling and systems security
Publish Year: 1392
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 1,536
This Paper With 13 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
CESD01_221
تاریخ نمایه سازی: 25 اسفند 1392
Abstract:
اکثر پروتئینها برای انجام وظایف بیولوژیکی خود، مجتمعهایی را تشکیل می دهند. در حالی که راههای تجربی بسیاری برای شناسایی مجتمعهای پروتئینی در آزمایشگاهها موجود است، اما محدودیتهای بسیاری برای این دسته از روشها وجود دارد. به همین علت، روشهای محاسباتی تکراری برای شناسایی مجتمع ها، مکمل مناسبی برای روشهای آزمایشی هستند. مدلسازی شبکه های تعاملی پروتئین پروتئین با گراف ساده در بسیاری از کاربردها از جمله، پیش بینی مجتمع های پروتئینی از شبکه های تعاملی پروتئین پروتئین مورد استفاده قرار گرفته است. مجتمع های پروتئینی به صورت زیرگرافهای متراکم در شبکه های تعاملی پروتئین پروتئین وجود دارند. از موفقترین فرایند خوشه بندی که برای استخراج مجتمع های شبکه تعاملی پروتئینی به کار رفته، میتوان الگوریتم خوشه بندی مارکوف نام برد، که دارای مشکلات و معایبی بسیاری است. در این مقاله، علاوه بر بررسی این الگوریتم، دو الگوریتم بهبود یافته ی روش خوشه بندی را نیز جهت شناسایی مجتمع های شبکه تعاملی پروتئینی ارائه خواهیم داد .
Keywords:
الگوریتم خوشه بندی مارکوف , شبکه های تعاملی پروتئین پروتئین , شناسایی مجتمع های پروتئینی
Authors
مریم خادمی
استادیار دانشگاه آزاد اسلامی واحد تهران جنوب
پونه خدابخش
دانشجوی کارشناسی ارشد مهندسی کامپیوتر - نرم افزار، دانشگاه آزاد اسلامی واحد تهران جنوب
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :