سیویلیکا را در شبکه های اجتماعی دنبال نمایید.

یک الگوریتم مکاشفهای برای حل مسئله ی معکوس تاشدگی ساختار RNA

Publish Year: 1391
Type: Conference paper
Language: Persian
View: 753
این Paper فقط به صورت چکیده توسط دبیرخانه ارسال شده است و فایل کامل قابل دریافت نیست. برای یافتن Papers دارای فایل کامل، از بخش [جستجوی مقالات فارسی] اقدام فرمایید.

نسخه کامل این Paper ارائه نشده است و در دسترس نمی باشد

Export:

Link to this Paper:

Document National Code:

IBIS04_005

Index date: 5 September 2014

یک الگوریتم مکاشفهای برای حل مسئله ی معکوس تاشدگی ساختار RNA abstract

عملکرد مولکول RNA اغلب وابسته به ساختار فضایی آن است. از این رو مسئله طراحی رشته نوکلئوتیدی یکRNA که به ساختار خاصی تا بخورد برای زیست شناسان، پزشکان و داروسازان حائز اهمیت است. این مسئله به مسئله معکوس تاشدگی معروف بوده و بدین صورت تعریف می شود که برای یک ساختار دوم RNA داده شده، هدف پیدا کردن دنباله نوکلئوتیدی است که ساختار دوم آن (با حداقل انرژی آزاد) مشابه با ساختار داده شده باشد. رویکردی که برای حل این مسئله در پیش گرفته شد بدینصورت است که ابتدا مولفه های تشکیل دهنده ساختار دوم هدف را بدست آورده و برای هر کدام از این مولفه ها رشته نوکلئوتیدی بهینه را با استفاده از یک الگوریتم مکاشفه ای محاسبه میشود، سپس رشته های نوکلئوتیدی این عناصر با هم ادغام میشوند تا رشته نوکلئوتیدی متناظر با ساختار هدف بدست بیاید. با توجه به زمان بر بودن الگوریتم های تاشدگی، مزیت این رویکرد نسبتبه رویکردهای موجود در این است که استفاده از این گونه الگوریتم ها را به حداقل رسانده و انتظار می رود نتایج بهتری نسبت به رویکردهای موجود ارائه شود

یک الگوریتم مکاشفهای برای حل مسئله ی معکوس تاشدگی ساختار RNA Keywords:

یک الگوریتم مکاشفهای برای حل مسئله ی معکوس تاشدگی ساختار RNA authors

محمد گنج تابش

گروه علوم کامپیوتر، دانشکده ریاضی، آمار و علوم کامپیوتر، دانشگاه تهران، تهران، ایران.

سیده مارال ضیایی

گروه علوم کامپیوتر، دانشکده ریاضی، آمار و علوم کامپیوتر، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران

سید شهریار عرب

گروه بیوفیزیک، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران

مقاله فارسی "یک الگوریتم مکاشفهای برای حل مسئله ی معکوس تاشدگی ساختار RNA" توسط محمد گنج تابش، گروه علوم کامپیوتر، دانشکده ریاضی، آمار و علوم کامپیوتر، دانشگاه تهران، تهران، ایران.؛ سیده مارال ضیایی، گروه علوم کامپیوتر، دانشکده ریاضی، آمار و علوم کامپیوتر، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران؛ سید شهریار عرب، گروه بیوفیزیک، دانشکده علوم زیستی، دانشگاه تربیت مدرس، تهران، ایران نوشته شده و در سال 1391 پس از تایید کمیته علمی چهارمین همایش بیوانفورماتیک ایران پذیرفته شده است. کلمات کلیدی استفاده شده در این مقاله ساختاردوم ،RNA ، تاشدگی،معکوس تاشدگی هستند. این مقاله در تاریخ 14 شهریور 1393 توسط سیویلیکا نمایه سازی و منتشر شده است و تاکنون 753 بار صفحه این مقاله مشاهده شده است. در چکیده این مقاله اشاره شده است که عملکرد مولکول RNA اغلب وابسته به ساختار فضایی آن است. از این رو مسئله طراحی رشته نوکلئوتیدی یکRNA که به ساختار خاصی تا بخورد برای زیست شناسان، پزشکان و داروسازان حائز اهمیت است. این مسئله به مسئله معکوس تاشدگی معروف بوده و بدین صورت تعریف می شود که برای یک ساختار دوم RNA داده شده، هدف پیدا کردن دنباله نوکلئوتیدی ... .