آنالیز بیوانفورماتیکی داده های ریزآرایه بیماری آنفولانزا و تعیین عوامل رونویسی over (Mice) در موش expressed

بیماری آنفولانزا توسط سه نوع ویروس B ،A و C از خانواده Orthomyxoviridae در پرندگان و پستانداران ایجا د می گردد، که دارای ژنوم نوع RNA می باشند. بسیاری از سیگنال های عملکردی ایمنی درون ذاتی بیماری آنفولانزا ناشناخته باقی مانده است که قطعا بررسی داده های ریزآرایه، در شناخت این سیگنال ها و نقش عملکردی آنها مفید است. در این پژوهش از بانک اطلاعاتی NCBI، کتابخانه ای از داده های ریزآرایه مربوط به تاثیر بیماری آنفولانزا بر غدد لنفاوی ناحیه ا ی موش آزمایشگاهیانتخاب شده و نرمال سازی داده ها با نرم افزارExpression Console V1.2 صورت گرفت. تعیینAnnotations ، دسته بندی تیمارها و همچنین بهینه سازی Symmetrical Fold Change و در نهایت آزمون t و آزمون Bayes t با( p value < 0.05) در نرم افزار FlexArray 1.6.1 انجام شد. آنالیز پرومتوری ژن هایover expressed با بیان معنی دار، توسط Gene2promoter از بانک اطلاعاتی Genomatix انجام گرفت. خروجی داده ها شامل 101 ژن بود که توسط بانک اطلاعاتی Genecards نقش عملکردی آنها تعیین شد. نتایج نشان داد که علاوه بر تعیین نقش عملکردی09 ژن از جملهSP1 ،KKLF ، SP4 ،KLF6، 11 ژن با عملکرد ناشناخته ،دارای بیان معنی داری در سیگنال ایمنی درون ذاتی بیماری آنفولانزا هستند.

Keywords:

آنفولانزا , ریزآرایه , بررسی بیان , بیوانفورماتیک