مقایسه بیوانفورماتیکی ترجیح کدونی ژنهای رمز کننده پمپ انتقال دهنده فلزات سنگین (P1B- ATPase) بین گیاهان و باکتریهای مختلف

به منظور بررسی و مقایسه ترجیح کدونی ژنهای رمز کننده پمپ انتقال دهنده فلزات سنگین (P1B – ATPase) در گیاهان و باکتریهای مختلف، توالینوکلئوتیدی ژن های مزبور از بانک اطلاعاتی EBI گرفته شد و از نظر ترجیح کدونی توسط سایتBioinformatics مورد تجزیه و تحلیل قرار گرفته و با هممقایسه شدند. نتایج نشان داد که در گیاهان برای اسید آمینههای دارای دو کدون در اکثر موارد کدونی ترجیح داده شد بود که انتهای آن نوکلئوتیدU بوددر حالی که در باکتری ها اکثرا از کدونی استفاده شده بود که انتهای آن C قرار داشت. در مورد اسید آمین ههای 4 کدونی در گیاهان بیشترین فراوانی مربوطبه کدونهایی بود که انتهای آنها C یا G بود در حالی که در باکتری ها کدون های با انتهای A یا U بیشترین فراوانی را داشتند. همچنین در حالت 6 کدونیبیشترین فراوانی در گیاهان و باکتریها مربوط به کدونهایی بود که انتهای آن ها C بود. مقایسه فراوانی ک دنها بین گیاهان و باکتر یها نشان داد که23 کدون از 46 کدن بین این دو گروه از موجودات در سطح 5% با هم اختلاف معنی داری دارند که این اختلاف بیشتر مربوط به کد نهای اسید آمین ههایدارای 3، 4 و 6 کدون بود. در حالی که بین اسید آمینههای دارای 2 کدون اختلاف کمتری مشاهده شد. به عنوان یک نتیجه کلی می توان گفت که گیاهان باباکتری ها از لحاظ ترجیح کدونی با هم اختلاف معنی داری دارند و این اختلاف در مورد اسید آمینه های با تعداد کدون زیادتر، بیشتر است.

Keywords:

ترجیح کدونی , فلزات سنگین , گیاهان , باکتریها