تایید تعلق جدایه های عامل بیماری لکه نواری یا نوار قهوه ای برنج به زیرگونه Acidovorax avenae subsp. Avenae با استفاده از توالی ژن Pil T

در فصل بهار سال 1392 از خزانه های برنج چندین شهر از استان مازندران بازدید و از گیاهچه هایی که دارای علائم نوارهای آبگز و قهوه ای در غلاف برگ و در برگ های پایینی بودند . نمونه برداری صورت گرفت. به چهل جدایه باکتری از گیاهچه های برنج از نقاط مختلف برنجکاری جدا و بیماریزایی انها روی برنج به اثبات رسید. بیماری نواری باکتریایی برنج در استان مازندران پراکندگی وسیعی داشت. پس از جداسازی و خالص سازی جدایه ها، DNA ژنومی 3 نماینده از 40 جدایه که بر اساس نمره دهی نقوش الکتروفورزی پروتئین های سلولی جدایه های باکتری عامل بیماری انتخاب شده بودند به روش لیز قلیایی استخراج شد. DNA ژنومی در واکنش زنجیره ای پلیمر از (PCR) برای تکثیر قطعه ای از ن خانه داری Pil T به کار برده شد. توالی قطعه DNA تکثیر شده تعیین گردید و با توالی های موجود در NCBI مقایسه شد. جدایه ها بیشترین شباهت را به زیرگونه Acidovorax avenae subsp. avenae (Aaa) داشتند. بیماری لکه نواری باکتریایی برنج با استفاده از ویژگی های فنوتیپی و تکثیر ناحیه ITS در ایران شناسایی شده بود.شناسایی جدایه عامل بیماری لکه نواری برنج بر اساس توالی ژن خانه دار یPil T برای اولین بار در ایران انجام شده و نسخه قطعی بودن شناسایی باکتری عامل بیماری نواری گیاهچه برنج به عنوان Aaa می باشد.

Keywords:

ا PCR , ژن خانه داری , بیماری , لکه نواری , برنج , باکتری