مقایسه بیوانفورماتیکی زیرواحدهای بزرگ و کوچک آنزیمRibulose-1,5-bisphosphate Carboxylase (Rubisco) در چند خانواده گیاهی
Publish place: 12th Congress of Iranian Genetics Society
Publish Year: 1393
Type: Conference paper
Language: Persian
View: 1,132
This Paper With 5 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- I'm the author of the paper
Export:
Document National Code:
CIGS13_0567
Index date: 27 January 2015
مقایسه بیوانفورماتیکی زیرواحدهای بزرگ و کوچک آنزیمRibulose-1,5-bisphosphate Carboxylase (Rubisco) در چند خانواده گیاهی abstract
آنزیم روبیسکو فراوانترین و مهمترین آنزیم حیات میباشد. زیر واحد بزرگ این آنزیم در کلروپلاست و زیرواحد کوچک آن در هسته سلول کد میشوند. با توجه به اهمیت بررسی بیشتر ماهیت روبیسکو و ویژگیهای مولکولی آن برای پی ریزی یک بنیان قوی برای افزایش بهره وری کاتالیتیکی آنزیم روبیسکو گیاهان زراعی و افزایش محصول فتوسنتز، در این مطالعه بررسی بیوانفورماتیکی زیرواحدهای بزرگ و کوچک آنزیمRibulose-1,5-bisphosphate Carboxylase انجام شد. توالیهای آمینواسیدی هر دو زیرواحد بزرگ و کوچک مربوط به 9 خانواده گیاهی از پایگاهUniprotبه فرمتFASTAدریافت شد، سپس خصوصیات فیزیکوشیمیائی و ساختارهای دوم پروتئینی به ترتیب با استفاده از سایتهایSopma و ProtParamبدست آمد. همردیفی توالیها با استفاده از نرم افزارCLC Main Workbench 5.5انجام و درختهای فیلوژنی توسط نرم افزارMEGA5.2 و با آزمون 500bootsrapeترسیم گردید. نتایج حاصل از سایتSopmaنشان داد کهβturn و Extended strand و Random coil و αHelixبه ترتیب بیشترین ساختارهای دوم زیرواحد بزرگ راتشکیل میدهند، در حالیکه در زیرواحد کوچکβturn و Random coilبه ترتیب، عنوان بیشترین و کمترین سهم از ساختارهای دوم را به خود اختصاص داده اند. نتایج حاصل از همردیفی نشان داد که زیر واحد بزرگ این آنزیم نسبت به زیرواحد کوچک، حفاظت شده تر میباشد. از طرفی بررسی فیلوژنی زیرواحدهای بزرگ و کوچک این آنزیم در میان گونههای مورد بررسی نشان میدهد که روابط تکاملی بدست آمده توسط توالی اسیدهای آمینه، با تاکسونومی سنتی گیاهی منطبق میباشد.
مقایسه بیوانفورماتیکی زیرواحدهای بزرگ و کوچک آنزیمRibulose-1,5-bisphosphate Carboxylase (Rubisco) در چند خانواده گیاهی Keywords:
مقایسه بیوانفورماتیکی زیرواحدهای بزرگ و کوچک آنزیمRibulose-1,5-bisphosphate Carboxylase (Rubisco) در چند خانواده گیاهی authors
مهسا مکانیک
دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی کشاورزی دانشگاه زنجان
رضا فتوت
عضو هیئت علمی دانشگاه زنجان
لیلا مرادی حقگو
دانشجوی دکتری بیوتکنولوژی کشاورزی دانشگاه زنجان
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :