بررسی صحت ارزیابی ژنومیک با استفاده از تراکمهای کم تا متوسط نشانگر

Publish Year: 1393
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 645

This Paper With 6 Page And PDF Format Ready To Download

  • Certificate
  • من نویسنده این مقاله هستم

استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:

لینک ثابت به این Paper:

شناسه ملی سند علمی:

CIGS13_0652

تاریخ نمایه سازی: 7 بهمن 1393

Abstract:

انتخاب ژنومیک، یک روش برای پیشبینی ارزشهای اصلاحی افراد با استفاده از شمار زیادی نشانگر است. هزینهی ژنوتیپ کردن تعدادزیادی نشانگر بالاست، که کاربرد گسترده انتخاب ژنومیک را محدود میکند. در این مطالعه، با استفاده از تراکم کم تا متوسط نشانگر، ارزشهای اصلاحی ژنومیک برآورد شد. یک صفت با وراثتپذیری0/1و0/2و0/4 درصد شبیهسازی شد. ژنوم شبیهسازی شده 25 جفت کروموزوم بدنی با طول یک مورگان داشت. شمار نشانگرها روی 25 کروموزوم12/5و27/5و50کیلوبودشمارqtl ها 125و250و 500 و 1000 در نظر گرفته شد که بهصورت تصادفی در طول کروموزومها توزیع شدند. میانگین حداقل مربعات صحت برآوردهای ژنومیک، بین سطوح متفاوت وراثتپذیری و بین تراکمهای متفاوت نشانگرها متفاوت بودP <0.05 نتایج نشان داد، در وراثت پذیری بالاتر با کاهش شمار نشانگرها، بهویژه در حالت زیاد بودن تعدادQTLها، صحت ارزیابی ژنومیک سریعتر کاهش مییابد

Keywords:

تراکم نشانگر , وراثتپذیری , صحت برآورد ارزشهای اصلاحی ژنومیک

Authors

نرجس گرگانی فیروزجاه

بخش علوم دامی- دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز

هادی آتشی

بخش علوم دامی- دانشکده کشاورزی، دانشگاه شیراز

مراجع و منابع این Paper:

لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :
  • Calus, M. P. L, Meuwissen, T. H. E., De Roos, ...
  • Goddard, M. E., (2009). "Genomic selection: Prediction of accuracy and ...
  • Habier, D., Fernando, R. L., &amp; Dekkers, J. C. M., ...
  • Hill, W. G., &amp; Robertson, A., (1968). "Linkage disequilibrium in ...
  • Meuwissen, T. H. E., Hayes, B. .J., &amp; Goddard, M. ...
  • _ Meuwissen, T., &amp; Goddard, M., (2010). "Accurate Prediction of ...
  • R Development Core Team (2011). "R: A Language and Environment ...
  • Sargolzaei, M., &amp; Schenkel, F. S., (2009). "QMSim: a large-scale ...
  • Schaeffer, L. R., (2006). "Strategy for applying genome-wide selection in ...
  • Solberg, T. R., Sonesson, A. K., Woolliams, .J. A., &amp; ...
  • VanRaden, P. M., OConnell, J. R., Wiggans, G. R., &amp; ...
  • Zhang, Z., Zhang, Q., &amp; Ding, X., (2011). "Advances in ...
  • نمایش کامل مراجع