مطالعه تشابه توالی نوکلئوتیدی آنزیمRNA Polymerase II در گونه های مختلفPenicillium

وجودRNA Polymeraseدر سلول برای ساخت زنجیره هایRNAبا استفاده ازDNAبه عنوان قالب ها ضروری است. همچنین این آنزیم در زندگی لازم و در همه ی اورگانیسم ها و خیلی از ویروس ها یافت شده است و عمل نسخه برداری در حضور این آنزیم صورت می گیرد. به عبارت دیگر، بیان ژن ها باRNA Polمرتبط بوده وبدون آن رخ نمی دهد. عمل رونویسی در یوکاریوت ها توسط 3 نوع مختلف از این آنزیم صورت می گیردRNA Pol I-IIIدر بررسی صورت گرفته ، توالی نوکلئوتیدیRNA Pol II10 گونه ی مختلف از قارچ Penicilliumاز بانک اطلاعاتی NCBI استخراج و توسط نرم افزارMEGA6 درخت فیلوژنی ترسیم شد پس ازآنالیز داده های مورد نظرP. amalieبه عنوان یک برون گروه 5 در گروه اول خوشه جای گرفت که نشان می دهدکمترین شباهت را با سایر اعضا دارد , همچنین گروه دوم دو شاخه تشکیل داده است که شامل 9 گونه می باشد درآن گونهP. madiritiکمترین میزان شباهت را با سایر اعضا گروه دوم دارد. باتوجه به کلاستر شاخه دوم از گروه دوم نیز دو زیر شاخه تقسیم شده که در این زیر شاخه دو گونه یP. copticola , P. terringenumبا100% بوت استرپ با شاخه اول خویشاوندی دارد . در انتها گونه هایP. , P. raphiae , P. quebecenseP. atrofulvum , christenseniaeبیشترین میزان شباهت را باهم دارند و دوگونهP. و P. pasqualensewellingtonense نیز دارای میزان شباهت کمتر از همدیگر و 45 % بوت استرپ وهمچنین 100 % بوت استرپ با 4 گونه ذکر شده قرابت دارد

Keywords:

آر آن ای پلیمراز , پنی سیلیوم , درخت فیلوژنی