بررسی بیوانفورماتیکی آنزیم کیتیناز جداسازی شده از گیاهCucurbita maxima

کیتین پلیمر پلیساکاریدی بدون شاخه و غیر محلول در آب میباشد که از مونومرهایN-استیلگلوکوزآمین تشکیل شده است و درسیستم اسکلتی حیوانات و در دیواره سلولی بسیاری از قارچها یافت میشود. این پلیمر یکی از فراوانترین پلیمرهای موجود در طبیعت به شمار میرود.آنزیمهای کیتیناز نوعی گلیکوزیلهیدرولاز با قدرت کاتالیز میباشند که قادرند پیوندهای گلیکوزیدیβ-1.4 را در بین واحدهایN-استیل گلوکز آمینGlcNAc بشکنند. کیتینازهای گیاهی برحسب تشابه در توالی اسیدهای آمینه، دامنههای ژنی، ساختاراولیه ، مکان جاگیری آنزیم در سلولها و بافتها و سایر خصوصیات تقسیمبندی میشوند.کیتینازهای کلاس 3 از نظر توالی و ساختار با سایر کلاسها مشابهتی ندارند و فاقد دامنه اتصال به کیتین میباشند. ناحیه کاتالیتیک کیتینازهای کلاس 3 به خانواده 18 گلیکوزیل هیدرولازهاتعلق داشته و در گروه 8 پروتئینهای مرتبط با بیماریزاییPR-8طبقهبندی میشوند. این کلاس از آنزیمها دامنه وسیعی از نقاط ایزوالکتریک وPHرا نشان داده و در دمای 60 تا 70 درجه سانتیگراد پایدار هستند. بررسی توالی نوکلئوتیدی ژن کیتیناز حاکی از آن است که این ژن دارای نواحی کد کننده ای به طول 879 جفت بازو حاوی 292 اسیدآمینه میباشد. در بلاست نوکلئوتیدی و پروتئینی و همچنینروابط نشان داده شده در درخت فیلوژنیکی، این ژن بیشترین شباهت و نزدیکی را به کیتیناز کلاس 3 و اسیدی جداسازی شده از گیاهCucumber نشان داد. تجزیه توالی کیتیناز برای تعیین موقعیت پروتئین در سلول، نشان داده که این پروتئینی خارج سلولی بوده و بررسی ساختار ثانویه این پروتئین موید حضور29/52درصد ساختار مارپیچ آلفا19/19درصد ساختار چین خورده بتا میباشد. شاخص آلیفاتیک 83/97برآورد شده که نشان دهنده مقاومت نسبتا بالای این آنزیم در برابر حرارت است

Keywords:

کیتیناز , کدوتنبل , بیوانفورماتیک