مطالعه پیوستگی ژنومی جهت شناساییQTLهای مؤثر بر برخی صفات مرتبط با تولید پشم
Publish place: 12th Congress of Iranian Genetics Society
Publish Year: 1393
نوع سند: مقاله کنفرانسی
زبان: Persian
View: 710
This Paper With 5 Page And PDF Format Ready To Download
- Certificate
- من نویسنده این مقاله هستم
استخراج به نرم افزارهای پژوهشی:
شناسه ملی سند علمی:
CIGS13_1183
تاریخ نمایه سازی: 7 بهمن 1393
Abstract:
هدف از این تحقیق بررسی کامل ژنوم گوسفند و شناسایی جایگاههای مرتبط با برخی صفات تأثیرگذار در کیفیت و کمیت پشم با استفاده از آرایههایOvine 50k SNP Chipاست که به طور همزمان چندشکلی را در حدود 54 هزار جایگاه نشانگری تکنوکلئوتیدیSNP مورد بررسی قرار میدهند. نمونههای خون از مجموع 94 حیوان شامل 47 رأس گوسفند لریبختیاری و 47 رأس گوسفند زل تهیه و پس از استخراجDNAتعیین ژنوتیپ نمونهها با استفاده از آرایههای مذکور انجام شد. نمونه پشم این حیوانات نیز جمعآوری و بااستفاده از فناوریOFDAآنالیز شدند. در این تحقیق سه صفت میانگین قطر الیاف، میزان تجعد و نسبت الیافی که مساوی یا بیشتر از 30 میکرومتر هستند مورد بررسی قرار گرفتند. در آنالیز پیوستگی هر صفت اثرات ثابت گله، سال تولد و جنس حیوان نیز مورد بررسی قرار گرفتند تا اثرات معنیدار به عنوان کواریت در آنالیز هر صفت در نظر گرفته شوند. آزمون پیوستگی ژنومی در نرم افزارPLINKموردارزیابی قرار گرفت و برای کنترل نرخ اشتباه از تصحیحFDRاستفاده شد. نتایج این تحقیق نشان داد که اثر جنس و گله بر روی صفات قطر الیاف و میزان تجعد و همچنین اثر جنس بر روی صفت نسبت الیافی که مساوی یا بیشتر از 30 میکرومتر هستند معنیدار میباشد P<0.05با در نظر گرفتن این اثرات در آنالیزهای پیوستگی در مجموع در این تحقیق سه جایگاه نشانگری روی کروموزومهای 1و 6(دو جایگاه) با اثر معنیداری بر روی صفت نسبت الیافی که مساوی یا بیشتر از 30 میکرومتر هستند شناسایی شد. نتایج این پژوهش نشان میدهد که انجام مطالعات بیشتر در این جایگاهها نقش مهمی در شناسایی ژنهای کاندید مؤثر بر کیفیت پشم در نژادهای ایرانی خواهد داشت
Keywords:
Authors
مهدیه راستی فر
دانشجوی کارشناسی ارشد و دانشیار پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج، ایران
اردشیر نجاتی جوارمی
دانشجوی کارشناسی ارشد و دانشیار پردیس کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه تهران، کرج، ایران
محمدحسین مرادی
استادیار دانشکده کشاورزی و منابع طبیعی دانشگاه اراک، اراک، ایران
مراجع و منابع این Paper:
لیست زیر مراجع و منابع استفاده شده در این Paper را نمایش می دهد. این مراجع به صورت کاملا ماشینی و بر اساس هوش مصنوعی استخراج شده اند و لذا ممکن است دارای اشکالاتی باشند که به مرور زمان دقت استخراج این محتوا افزایش می یابد. مراجعی که مقالات مربوط به آنها در سیویلیکا نمایه شده و پیدا شده اند، به خود Paper لینک شده اند :