با افزایش جمعیت و فعالیت انسانها مصرف آب نیز زیادتر می شود و نیاز روز افزون بشر را مجبور به استفاده از
آبهای زیرزمینی مانند چاهها ، قناتها و چشمه ها جهت شرب کرده است . راه یابی انواع آلاینده ها مانند فاضلابهای خانگی ، شهری ، صنعتی ، کشاورزی و زائدات جامد و مایع به منابع
آبهای زیرزمینی از جمله چاهها آلودگی آنها را در بر دارد و در
این میان بررسی آلودگیهای میکروبیولوژی از جمله باکتریها ، قارچها ، جلبکها و ویروسها بلحاظ بهداشت آب و استفاده از آب چاهها جهت شرب حائز اهمیت می باشد .
به منظور شناخت ویژگی ها وحفاظت از منابع
آبهای زیرزمینی لازم است عوامل فیزیکی ، شیمیایی وبیولوژیکی آن منطقه کاملا بررسی گردد . عوامل زیستی و اکولوژی
آبهای زیرزمینی از اهمیت ویژه ای برخورداراست از طرفی عوامل پاتوژنیک راه یافته از فاضلابها بهداشت وسلامت مردم را تهدید می نماید . در بررسی بعمل آمده در چاهها وچشمه های دشت شوش ، ایذه ، دشت زیدون ، چشمه های شوشتر و رامهرمز خوزستان شاخص
کلیفرم بعنوان آْلودگی به فاضلاب در نظر گرفته شد . در این مطالعه مشخص گردید که
آلودگی میکروبی در منابع کم عمق زیادتر از منابع عمیق بود و در مناطقی که اندازه خلل و فرج خاک و شکاف یا حفره سنگها زیاد باشد ویا در پریودهای بارندگی نشت آْلودگی بیشتر صورت خواهد گرفت . بطوریکه در منابع کم عمق رامهرمز و ایذه میانگین توتال
کلیفرم MPN/100ml به ترتیب 5505 ، 1393 بدست آمده است . لذا بهتر است حداقل سیستم تصفیه آب زیرزمینی بترتیب شامل مراحل : هوادهی ، فیلتراسیون و کلرزنی مورد استفاده قرار گیرد و نهایتا وارد شبکه توزیع آب بشود .